More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2031 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  48.92 
 
 		 832 aa  738    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  44.19 
 
 		 833 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 849 aa  1719    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  41.61 
 
 		 811 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  37.74 
 
 		 821 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 815 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  35.43 
 
 		 842 aa  405  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 811 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 843 aa  361  4e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 835 aa  352  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  32.26 
 
 		 804 aa  345  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 795 aa  342  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 853 aa  339  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  31.57 
 
 		 811 aa  339  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  32.3 
 
 		 800 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 797 aa  334  4e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 797 aa  333  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  32.57 
 
 		 800 aa  333  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  30.02 
 
 		 840 aa  333  9e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  30.94 
 
 		 797 aa  333  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 817 aa  330  8e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 847 aa  328  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  32.31 
 
 		 784 aa  324  5e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 871 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 803 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 818 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 883 aa  320  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 812 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 812 aa  320  9e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 797 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 812 aa  317  5e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  31.81 
 
 		 884 aa  317  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 		 793 aa  309  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  31.25 
 
 		 793 aa  309  2.0000000000000002e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  31.95 
 
 		 815 aa  307  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 816 aa  301  3e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  28.67 
 
 		 961 aa  300  8e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 918 aa  296  8e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 813 aa  296  8e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 795 aa  296  9e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 788 aa  293  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  30.3 
 
 		 788 aa  292  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 853 aa  291  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  31.52 
 
 		 795 aa  289  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  29.71 
 
 		 885 aa  287  5e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  28.62 
 
 		 842 aa  285  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 803 aa  285  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  28.36 
 
 		 797 aa  282  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.99 
 
 		 799 aa  282  2e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 987 aa  278  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 		 924 aa  273  9e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 933 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 924 aa  267  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 887 aa  267  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 874 aa  263  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  28.88 
 
 		 856 aa  262  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 858 aa  262  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 861 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 857 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  29.55 
 
 		 870 aa  259  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 873 aa  257  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 948 aa  257  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 858 aa  251  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 851 aa  251  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 852 aa  249  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 847 aa  249  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 947 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 800 aa  248  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 817 aa  248  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 868 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  29.21 
 
 		 848 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 872 aa  236  9e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  28.85 
 
 		 823 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 850 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  27.21 
 
 		 867 aa  233  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  27.96 
 
 		 864 aa  232  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 879 aa  231  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  27.63 
 
 		 1015 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 867 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 867 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 870 aa  134  6e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 869 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2618  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 849 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000702632  normal  0.386313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 877 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  34.06 
 
 		 948 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3121  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 884 aa  104  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518679 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2001  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 867 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00988263  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2353  TonB-dependent receptor  35.89 
 
 		 908 aa  90.1  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.880322  normal  0.439021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 873 aa  90.1  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  35.51 
 
 		 874 aa  89  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2907  TonB-dependent receptor domain-containing protein  34.76 
 
 		 884 aa  87  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1497  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 883 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0195918 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1564  TonB-dependent receptor  34.29 
 
 		 883 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0877437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1558  TonB-dependent receptor  34.76 
 
 		 883 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.786788  normal  0.359395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1988  TonB-dependent receptor  34.36 
 
 		 1020 aa  85.9  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 875 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2548  TonB-dependent receptor  32.91 
 
 		 1001 aa  85.1  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  32.16 
 
 		 873 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  31.76 
 
 		 928 aa  83.6  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 869 aa  84  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>