More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0072 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 322 aa  651    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  50 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4522  AraC family transcriptional regulator  45.48 
 
 		 344 aa  272  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2777  AraC family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 325 aa  269  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1588  transcriptional regulator, AraC family  45.79 
 
 		 325 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1608  transcriptional regulator, AraC family  46.88 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.889742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1684  transcriptional regulator, AraC family  46.88 
 
 		 334 aa  262  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.943057  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2267  AraC family transcriptional regulator  46.56 
 
 		 334 aa  255  7e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0311911  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6076  transcriptional regulator, AraC family  41.56 
 
 		 349 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.132925 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7171  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 335 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1005  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.829176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4609  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 318 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1108  helix-turn-helix domain-containing protein  39.44 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.18334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2055  helix-turn-helix domain-containing protein  37.46 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.580001 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5663  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3284  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2606  transcriptional regulator, AraC family  34.17 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1659  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 348 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.278996 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7382  transcriptional regulator AraC family  33.12 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1816  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 333 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2439  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 325 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241537 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 311 aa  149  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2376  AraC family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 342 aa  148  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.912933  normal  0.295563 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2897  transcriptional regulator, AraC family  32.6 
 
 		 329 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.825187  normal  0.500009 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2971  AraC family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1617  AraC family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.583151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1005  helix-turn-helix domain-containing protein  29.19 
 
 		 327 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  33.54 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0292  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1435  transcriptional regulator, AraC family  33.44 
 
 		 324 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.215963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  38.02 
 
 		 234 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1175  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 		 332 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4017  transcriptional regulator, AraC family  32.7 
 
 		 308 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4383  AraC family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 332 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433153  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 345 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5085  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0266874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1052  transcriptional regulator, AraC family  31.35 
 
 		 314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.2685  normal  0.950103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7194  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2769  AraC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  28.26 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2479  transcriptional regulator, AraC family  36.41 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8693  transcriptional regulator, AraC family  30.37 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1769  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158961  normal  0.542492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03650  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1540  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000047582  hitchhiker  0.00155056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  31.02 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7590  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 310 aa  122  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9089  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 349 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 348 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2110  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6348  transcriptional regulator, AraC family  30.32 
 
 		 301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4168  helix-turn-helix domain-containing protein  28.62 
 
 		 329 aa  119  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal  0.28666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1516  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7080  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 306 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3528  AraC family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.680996  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  37.7 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4455  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 214 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2515  transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 295 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0607329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  31.62 
 
 		 310 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5532  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.501091 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5151  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5240  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3619  histidine kinase  29.11 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.499169  normal  0.14127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3213  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1375  AraC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 305 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0970899 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6114  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 318 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 305 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12440  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  31.17 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1378  transcriptional regulator, AraC family  27.62 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  29.23 
 
 		 315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 325 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3075  AraC family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5298  transcriptional regulator, AraC family  27.99 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00273458  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3360  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5293  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 344 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.273034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5007  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1449  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.380314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1407  transcriptional regulator, AraC family  27.81 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3375  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0121717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3366  transcriptional regulator, AraC family  31.5 
 
 		 309 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.608408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2522  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 295 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3311  AraC family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 297 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000434384 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0256  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 295 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.88341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1118  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 300 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>