134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2543 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2543  CpaB family Flp pilus assembly protein  100 
 
 
292 aa  553  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1788  putative pilus assembly protein CpaB  88.7 
 
 
299 aa  441  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1291  hypothetical protein  88.36 
 
 
299 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1940  CpaB family Flp pilus assembly protein  88.7 
 
 
348 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0235089  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1779  hypothetical protein  88.36 
 
 
299 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0116  hypothetical protein  88.36 
 
 
299 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1767  putative pilus assembly protein CpaB  88.7 
 
 
299 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.726426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1049  putative pilus assembly protein CpaB  88.36 
 
 
299 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.342434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  66.89 
 
 
300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  66.22 
 
 
301 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  66.22 
 
 
301 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  66.22 
 
 
301 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  66.33 
 
 
301 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  57.01 
 
 
313 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  63.08 
 
 
311 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  50 
 
 
316 aa  245  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  48.23 
 
 
316 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  40.12 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  40 
 
 
318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3653  pilus assembly protein  40.73 
 
 
319 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588333  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4357  Flp pilus assembly protein CpaB  40.28 
 
 
307 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4247  Flp pilus assembly protein CpaB  40.28 
 
 
307 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2320  Flp pilus assembly protein CpaB  37.16 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2073  Flp pilus assembly protein CpaB  38 
 
 
363 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10677  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2705  hypothetical protein  38.62 
 
 
323 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.787376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2327  Flp pilus assembly protein CpaB  38.62 
 
 
323 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296928  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  31.23 
 
 
299 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_003296  RS02596  signal peptide protein  43.92 
 
 
208 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.818766 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  32.3 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0849  Flp pilus assembly protein CpaB  34.98 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  34.26 
 
 
317 aa  79  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  36.79 
 
 
316 aa  77  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  35.17 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4872  Flp pilus assembly protein CpaB  35.5 
 
 
303 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0982615  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  29.74 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  29.74 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  29.74 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  31.98 
 
 
282 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  32.82 
 
 
307 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55930  putative pilus assembly protein  34.26 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319663  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  28.96 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  29.29 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  28.57 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4850  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  29.02 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  30.46 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  30.46 
 
 
279 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  32.31 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4390  Flp pilus assembly CpaB  28.41 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.752776  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  31.05 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  28.32 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  28.94 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  28.57 
 
 
284 aa  67  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  30.53 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  27.98 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  34.01 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  29.73 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  27.84 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  29.73 
 
 
281 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  31.28 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  29.32 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0649  Flp pilus assembly CpaB  29.7 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  29.05 
 
 
261 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  29.46 
 
 
262 aa  62.4  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  30.45 
 
 
267 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  27.27 
 
 
269 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  27.75 
 
 
272 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  29.41 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  32.62 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  29.11 
 
 
265 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  30.83 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  30.56 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  26.99 
 
 
272 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  33.33 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0750  Flp pilus assembly protein CpaB  25.08 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  27.43 
 
 
288 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  30.8 
 
 
261 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4344  Flp pilus assembly protein CpaB  29.28 
 
 
339 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.684033  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  31.73 
 
 
261 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  30.12 
 
 
296 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  32.13 
 
 
260 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  29.47 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  31.77 
 
 
233 aa  56.6  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3486  Flp pilus assembly protein CpaB  29.11 
 
 
292 aa  56.2  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0314928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  33.06 
 
 
274 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  31.55 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  32.2 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  30.77 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  30.1 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  27.41 
 
 
291 aa  53.5  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2919  putative Flp pilus assembly CpaB  28.5 
 
 
363 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  28.72 
 
 
275 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  30.49 
 
 
263 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  30.85 
 
 
270 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  26.96 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2460  CpaB family Flp pilus assembly protein  28.89 
 
 
345 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0968707  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6874  Flp pilus assembly protein CpaB  29.61 
 
 
366 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.367067  normal  0.327856 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  27.23 
 
 
345 aa  50.8  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0706  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  24.03 
 
 
298 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0646  SAF domain-containing protein  25.53 
 
 
298 aa  49.7  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.361703 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>