190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCB4264_A3326 on replicon NC_011725
Organism: Bacillus cereus B4264



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  93.58 
 
 
374 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  92.51 
 
 
374 aa  721    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  91.98 
 
 
374 aa  717    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  91.98 
 
 
374 aa  720    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  92.51 
 
 
374 aa  721    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  93.32 
 
 
374 aa  727    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  92.25 
 
 
374 aa  721    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  100 
 
 
374 aa  773    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  86.78 
 
 
242 aa  437  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  47.41 
 
 
368 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  43.6 
 
 
374 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  41.6 
 
 
380 aa  272  9e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  35.79 
 
 
369 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  29.43 
 
 
372 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  24.44 
 
 
359 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  26.37 
 
 
358 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  24.21 
 
 
361 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  24.18 
 
 
364 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  26.89 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  58.33 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  51.67 
 
 
163 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  55 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  33.33 
 
 
114 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  33.33 
 
 
114 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25650  predicted transcriptional regulator  43.55 
 
 
194 aa  60.8  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  51.92 
 
 
146 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  40.98 
 
 
142 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  48.08 
 
 
436 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  38.16 
 
 
262 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 
205 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  27.78 
 
 
142 aa  58.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
276 aa  58.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  41.54 
 
 
145 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 
262 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
197 aa  57  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 
139 aa  57  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  46.15 
 
 
200 aa  57  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 
235 aa  57  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
183 aa  56.6  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  45.76 
 
 
142 aa  56.6  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0007  DNA-binding protein  40 
 
 
143 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.479978  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 
459 aa  55.8  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  42.86 
 
 
210 aa  55.5  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  27.86 
 
 
327 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  46.15 
 
 
197 aa  55.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  49.09 
 
 
293 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  48.21 
 
 
321 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  42.62 
 
 
262 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15990  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 
196 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000020134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25890  predicted transcriptional regulator  44.64 
 
 
272 aa  55.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 
163 aa  54.3  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0008  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 
107 aa  54.7  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000363546  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  45.9 
 
 
328 aa  54.7  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  46.15 
 
 
262 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  40.38 
 
 
338 aa  53.5  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
266 aa  52.8  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 
137 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  39.29 
 
 
92 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  39.29 
 
 
149 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  40.32 
 
 
186 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0047  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
192 aa  52.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.139805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  35.9 
 
 
137 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  38.6 
 
 
149 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  39.29 
 
 
149 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  30.1 
 
 
115 aa  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 
170 aa  52  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1096  Xre family transcriptional regulator  34.62 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0300761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 
231 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  33.8 
 
 
104 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  39.29 
 
 
149 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
135 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 
149 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  34.33 
 
 
197 aa  51.2  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18420  predicted transcriptional regulator  36.67 
 
 
149 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.189768  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 
273 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
134 aa  50.8  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0517  DNA-binding protein  42.59 
 
 
67 aa  50.8  0.00004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00223122 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0016  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 
185 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  37.5 
 
 
149 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
133 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 
189 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  35.21 
 
 
189 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 
132 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 
197 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2840  transcriptional regulator, XRE family  39.22 
 
 
176 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1789  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 
198 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000770501  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  34.41 
 
 
125 aa  49.7  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 
247 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 
268 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1998  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 
131 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5021  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
147 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621734  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0308  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 
144 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25910  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  32.81 
 
 
144 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1626  putative phage repressor  33.9 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0099  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  31.82 
 
 
296 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  34.85 
 
 
206 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3505  transcriptional regulator, XRE family  24.55 
 
 
135 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.497351 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>