More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5689 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  291  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  56.46 
 
 		 190 aa  160  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 169 aa  120  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3564  MarR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 172 aa  113  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 161 aa  111  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  40.56 
 
 		 151 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 148 aa  106  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  40.29 
 
 		 150 aa  105  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  43.36 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 178 aa  104  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 162 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0421  MarR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 162 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.799944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 162 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 162 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  37.06 
 
 		 177 aa  94.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4590  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 185 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.777081  normal  0.899831 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5123  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 179 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 176 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 184 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3042  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125227  hitchhiker  0.00142823 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3696  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.134225  normal  0.172711 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4283  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0934  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 303 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1065  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0841827  normal  0.196346 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2197  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0027451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  38.58 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  28.91 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2856  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.59 
 
 		 178 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  32.11 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  25.71 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  29.77 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1137  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 167 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  30.47 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  33.63 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3991  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  28.21 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>