More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2183 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  49.1 
 
 		 1443 aa  1275    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 1557 aa  3203    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  53.3 
 
 		 1474 aa  1395    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  50.09 
 
 		 1367 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  51.16 
 
 		 1211 aa  556  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  50.17 
 
 		 1357 aa  554  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  48.35 
 
 		 1598 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  49.74 
 
 		 919 aa  530  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  47.42 
 
 		 1626 aa  531  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  77.68 
 
 		 1240 aa  526  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  44.96 
 
 		 1523 aa  517  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  41.28 
 
 		 1652 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  45.96 
 
 		 1552 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.46 
 
 		 1609 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  45.93 
 
 		 1607 aa  515  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  47.04 
 
 		 1363 aa  513  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  44.46 
 
 		 947 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  44.94 
 
 		 1547 aa  509  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  45.98 
 
 		 1163 aa  505  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  39.26 
 
 		 1196 aa  504  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 1221 aa  502  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  44.77 
 
 		 1454 aa  492  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  43.15 
 
 		 1789 aa  492  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  37.62 
 
 		 1190 aa  485  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.88 
 
 		 1583 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  38.67 
 
 		 1188 aa  482  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  29.73 
 
 		 1868 aa  478  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  45.12 
 
 		 1217 aa  476  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  44.06 
 
 		 1364 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  36.85 
 
 		 1193 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  44.8 
 
 		 1510 aa  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  34.99 
 
 		 1213 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  45.44 
 
 		 1481 aa  455  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  44.81 
 
 		 696 aa  452  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  44.63 
 
 		 1553 aa  452  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  43.55 
 
 		 1711 aa  445  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  40.89 
 
 		 1623 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  42.33 
 
 		 1236 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  34.41 
 
 		 1247 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  39.93 
 
 		 1684 aa  438  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.93 
 
 		 1686 aa  438  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.78 
 
 		 1599 aa  438  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  43.32 
 
 		 1656 aa  432  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  38.56 
 
 		 1617 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  40.73 
 
 		 1661 aa  422  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  30.3 
 
 		 1766 aa  415  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  48.13 
 
 		 1267 aa  406  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  37.38 
 
 		 1262 aa  395  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  27.94 
 
 		 1901 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1807 aa  391  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  42.91 
 
 		 930 aa  393  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  36.13 
 
 		 1161 aa  390  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  35.95 
 
 		 1161 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  42.38 
 
 		 1229 aa  388  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.43 
 
 		 1760 aa  386  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  38.58 
 
 		 1416 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  27.64 
 
 		 1831 aa  376  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  31.58 
 
 		 1208 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  35.71 
 
 		 1164 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  32.7 
 
 		 1411 aa  365  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.34 
 
 		 1188 aa  365  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  33.75 
 
 		 728 aa  365  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  37.72 
 
 		 1714 aa  364  6e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  35.51 
 
 		 1176 aa  364  9e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  38.35 
 
 		 924 aa  363  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  49 
 
 		 1398 aa  362  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  37.6 
 
 		 1491 aa  360  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  38.26 
 
 		 1348 aa  358  5.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  36.06 
 
 		 1344 aa  355  5e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  37.03 
 
 		 1242 aa  349  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  40.95 
 
 		 1280 aa  347  7e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  34.8 
 
 		 1177 aa  345  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  35.42 
 
 		 1399 aa  338  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  35.19 
 
 		 1209 aa  321  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  31.63 
 
 		 1190 aa  320  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3558  protein kinase  33.5 
 
 		 1100 aa  315  4.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.911308  normal  0.0649803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  34.41 
 
 		 505 aa  315  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  34.03 
 
 		 1330 aa  314  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  32.48 
 
 		 1373 aa  314  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  42.6 
 
 		 1599 aa  314  9e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.34 
 
 		 1856 aa  309  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1209 aa  308  8.000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1304 aa  303  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  31.61 
 
 		 1016 aa  296  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  31.61 
 
 		 1016 aa  296  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  35.13 
 
 		 1484 aa  295  4e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  32 
 
 		 1214 aa  295  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.27 
 
 		 1072 aa  291  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.65 
 
 		 1072 aa  287  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.96 
 
 		 1076 aa  286  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 1334 aa  285  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  30.7 
 
 		 1264 aa  284  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  30.7 
 
 		 1264 aa  284  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  48.38 
 
 		 716 aa  279  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.84 
 
 		 1823 aa  278  8e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  34.1 
 
 		 608 aa  277  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  31.9 
 
 		 1311 aa  277  1.0000000000000001e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  48.83 
 
 		 675 aa  277  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  38.42 
 
 		 1858 aa  276  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  45.45 
 
 		 737 aa  268  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>