More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1670 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  89.89 
 
 		 204 aa  353  7.999999999999999e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  58.02 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  51.93 
 
 		 180 aa  190  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  51.89 
 
 		 186 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  54.22 
 
 		 182 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  53.01 
 
 		 182 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  55.83 
 
 		 183 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  49.73 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  54.32 
 
 		 188 aa  176  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  54.32 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  56.79 
 
 		 180 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  53.7 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  54.32 
 
 		 183 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  54.6 
 
 		 168 aa  167  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  54.6 
 
 		 167 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  47.49 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  53.75 
 
 		 161 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  50.28 
 
 		 191 aa  159  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  49.69 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  49.69 
 
 		 162 aa  158  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  50.31 
 
 		 162 aa  158  5e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  52.17 
 
 		 162 aa  157  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  48.75 
 
 		 162 aa  153  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  46.77 
 
 		 184 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  47.8 
 
 		 162 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  53.09 
 
 		 181 aa  150  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  47.2 
 
 		 162 aa  149  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  48.1 
 
 		 164 aa  147  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  49.36 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  39.21 
 
 		 230 aa  144  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  50 
 
 		 162 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  44.69 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  45.93 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  47.09 
 
 		 190 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  47.67 
 
 		 183 aa  142  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  45.81 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  45.81 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  45.81 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  48.88 
 
 		 213 aa  141  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  44.69 
 
 		 197 aa  141  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  46.15 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  53.09 
 
 		 177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  47.46 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  43.33 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  44.32 
 
 		 192 aa  135  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0358  peptide deformylase  46.24 
 
 		 227 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  50 
 
 		 159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3853  peptide deformylase  47.02 
 
 		 150 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  46.01 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  44.09 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  51.25 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  45.93 
 
 		 188 aa  128  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09890  peptide deformylase  48.98 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  46.45 
 
 		 190 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  42.44 
 
 		 190 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  42.94 
 
 		 230 aa  124  8.000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0402  peptide deformylase  46.2 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0978833  normal  0.0252019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2314  peptide deformylase  45.89 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.566498  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  42.22 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  44.9 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  46.75 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  48.18 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2492  peptide deformylase  44.08 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  43.21 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  41.67 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  39.58 
 
 		 225 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1320  peptide deformylase  43.95 
 
 		 167 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.369931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  43.8 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  43.62 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0021  peptide deformylase  42.53 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  43.75 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  48.48 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0055  peptide deformylase  43.79 
 
 		 168 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  43.92 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  43.62 
 
 		 164 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  45.27 
 
 		 168 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  45.95 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  41.67 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0017  peptide deformylase  43.92 
 
 		 168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000267775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0015  peptide deformylase  42.86 
 
 		 167 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1952  peptide deformylase  44.22 
 
 		 157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  43.92 
 
 		 147 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  45.95 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  43.21 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0442  peptide deformylase  38.32 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.33127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0874  peptide deformylase  41.4 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2648  hypothetical protein  42.5 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2518  hypothetical protein  42.5 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  44.83 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0041  peptide deformylase  43.23 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0897  peptide deformylase  43.54 
 
 		 155 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0279496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1039  peptide deformylase  42.76 
 
 		 166 aa  112  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  42.76 
 
 		 167 aa  112  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  43.42 
 
 		 167 aa  111  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  45.27 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  45.86 
 
 		 176 aa  110  9e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0976  peptide deformylase  37.58 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1035  peptide deformylase  37.58 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  44.16 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>