More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0792 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 353 aa  731    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  46.61 
 
 		 375 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  48.57 
 
 		 364 aa  327  3e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  47.66 
 
 		 367 aa  323  4e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  43.77 
 
 		 372 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  48.34 
 
 		 381 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  45.15 
 
 		 380 aa  308  6.999999999999999e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  41.16 
 
 		 378 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  41.16 
 
 		 377 aa  306  3e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  41.16 
 
 		 377 aa  306  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  41.16 
 
 		 377 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  44.41 
 
 		 372 aa  302  5.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  47.52 
 
 		 364 aa  301  2e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  43.87 
 
 		 386 aa  299  4e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  45.41 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  43.57 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  44.57 
 
 		 359 aa  288  7e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  47.25 
 
 		 367 aa  288  8e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  42.71 
 
 		 444 aa  286  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  41.67 
 
 		 378 aa  285  9e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  42.78 
 
 		 369 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.4 
 
 		 397 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  43.53 
 
 		 414 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  42.98 
 
 		 368 aa  278  8e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  43.15 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  43.73 
 
 		 394 aa  276  3e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  43.05 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  39.7 
 
 		 342 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  41.11 
 
 		 399 aa  269  4e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  41.34 
 
 		 370 aa  268  8.999999999999999e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  39 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  42.82 
 
 		 392 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  40.16 
 
 		 382 aa  263  3e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  40.87 
 
 		 346 aa  259  7e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  40.76 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  41.85 
 
 		 375 aa  256  6e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  37.36 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  37.5 
 
 		 349 aa  249  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 		 347 aa  232  6e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  37.18 
 
 		 366 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 		 357 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  34.75 
 
 		 561 aa  223  4e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  34.58 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  36.02 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  34.58 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  35.06 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 		 358 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  32.77 
 
 		 381 aa  205  9e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  35.84 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  34.25 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  37.75 
 
 		 769 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  33.8 
 
 		 349 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  33.8 
 
 		 479 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 496 aa  189  7e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  33.92 
 
 		 335 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  32.26 
 
 		 330 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 		 332 aa  176  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 		 330 aa  176  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 501 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  31.64 
 
 		 333 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  31.52 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  31.44 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  31.63 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  32.55 
 
 		 334 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  31.49 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  35.13 
 
 		 382 aa  159  6e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  31.61 
 
 		 390 aa  157  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  40.71 
 
 		 413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 		 480 aa  155  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  30.64 
 
 		 378 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  32.23 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  31.32 
 
 		 373 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  30.42 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  30.3 
 
 		 422 aa  143  5e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  30.31 
 
 		 395 aa  142  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  30.31 
 
 		 391 aa  142  8e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  30.75 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  29.38 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  30.77 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 405 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  29.48 
 
 		 393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 377 aa  139  7e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 393 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 		 402 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.9 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 390 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 389 aa  137  2e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 		 415 aa  136  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  29.94 
 
 		 380 aa  136  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  31.02 
 
 		 342 aa  137  4e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>