105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1887 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1887  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 213 aa  441  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000139427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1286  TPR domain-containing protein  39.27 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0547  tetratricopeptide repeat domain protein  31.49 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0590314  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.65 
 
 		 730 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 927 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1069 aa  56.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.42 
 
 		 620 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  24.86 
 
 		 620 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.76 
 
 		 810 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 543 aa  52.4  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.48 
 
 		 878 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.14 
 
 		 3035 aa  51.6  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1276 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 288 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  22.86 
 
 		 267 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  21.76 
 
 		 1297 aa  51.2  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  27.84 
 
 		 1013 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  26.14 
 
 		 560 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 591 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 4079 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4648  TPR repeat-containing protein  19.91 
 
 		 520 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649741  normal  0.91098 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.94 
 
 		 265 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  33.85 
 
 		 1101 aa  49.3  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 512 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  28.11 
 
 		 564 aa  48.5  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 562 aa  48.5  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.82 
 
 		 739 aa  48.5  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 243 aa  48.5  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 414 aa  48.5  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  26.56 
 
 		 276 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 		 713 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.31 
 
 		 1486 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  20.41 
 
 		 366 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 3560 aa  48.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 		 615 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  22.35 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1768  TPR repeat-containing protein  23.02 
 
 		 492 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 711 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2674  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.717454  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 		 333 aa  46.6  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0535  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 596 aa  46.6  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  21.56 
 
 		 448 aa  46.2  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25 
 
 		 1138 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 1067 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  32.31 
 
 		 815 aa  45.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  21.91 
 
 		 742 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 602 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.07 
 
 		 397 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 465 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 612 aa  45.4  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.82 
 
 		 632 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 740 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 636 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  19.19 
 
 		 265 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 465 aa  45.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.69 
 
 		 1979 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 637 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  22.9 
 
 		 576 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  29.07 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2801  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.462521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  24.53 
 
 		 1240 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 		 700 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  24.72 
 
 		 1154 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.86 
 
 		 738 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 750 aa  43.9  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 639 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.1 
 
 		 689 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 589 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 		 349 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  26.56 
 
 		 338 aa  43.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  29.87 
 
 		 391 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 1049 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 635 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 635 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.68 
 
 		 739 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 611 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.48 
 
 		 410 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  19.49 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  21.39 
 
 		 979 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 		 3172 aa  42.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.18 
 
 		 264 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 		 1094 aa  42.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.43 
 
 		 784 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 376 aa  42.4  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  24.5 
 
 		 822 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  24.56 
 
 		 402 aa  42.4  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 280 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 252 aa  42.4  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2390  tetratricopeptide TPR_2  30.65 
 
 		 230 aa  42  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3714  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 		 185 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 385 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0986  TPR repeat-containing protein  23.42 
 
 		 479 aa  42  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.461111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 1005 aa  42  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  35.19 
 
 		 1000 aa  42  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  21.47 
 
 		 435 aa  41.6  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  28.95 
 
 		 929 aa  41.6  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  23.94 
 
 		 1073 aa  41.6  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.64 
 
 		 373 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>