167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30910 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 219 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  43.67 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  39.24 
 
 		 278 aa  99  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1364  phosphoribosyltransferase  45.05 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.771666 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 268 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  43.08 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  37.77 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  38.82 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 342 aa  85.1  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  39.44 
 
 		 213 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  39.9 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  37.78 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  39.27 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  39.27 
 
 		 204 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  42.23 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6307  phosphoribosyltransferase  46.92 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.246452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  42.79 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.54 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.79 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  37.78 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  38.22 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  22.73 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  30.52 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  37.5 
 
 		 207 aa  72  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 213 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  32.55 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  37.78 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  24.78 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.07 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  38.6 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.89 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  29.89 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  33.92 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  28.97 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  24.77 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  38 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  26.82 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 270 aa  62  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  32.67 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  34.31 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  30.62 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.58 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  38.84 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  32.3 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  22.71 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  26.11 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  28.89 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  32.57 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  35.48 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  22.17 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  34.09 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5842  phosphoribosyltransferase  39.91 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0237532  normal  0.254841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.03 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3812  hypothetical protein  44.6 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341981  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  26.34 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  20.75 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  24.06 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  34.02 
 
 		 274 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  28.82 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  25.48 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  32.69 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 282 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  20.59 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  32.34 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  25.71 
 
 		 243 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  27.83 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  28.83 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  31.82 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 265 aa  52  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  36.25 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  24.77 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  27.88 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  23.18 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  23.58 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  30.89 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  21.23 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  32.31 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  24.79 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  26.13 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  31.05 
 
 		 269 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>