254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1415 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
268 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  61.21 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  51.26 
 
 
244 aa  129  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  44.59 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  45.09 
 
 
234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  43.06 
 
 
219 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  44.84 
 
 
204 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  48.43 
 
 
259 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  44.39 
 
 
204 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  44.39 
 
 
204 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 
244 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  39.51 
 
 
215 aa  100  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  45.65 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  42.22 
 
 
220 aa  99  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09370  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.89 
 
 
299 aa  94  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  40.38 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  40.48 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  47.16 
 
 
202 aa  90.9  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  41.35 
 
 
342 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
227 aa  89  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  43.52 
 
 
213 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  43.36 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
230 aa  83.2  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  34.16 
 
 
243 aa  82  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  29.6 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  26.52 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  29 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  35.98 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  29.2 
 
 
217 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  29.2 
 
 
217 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.4 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  33.03 
 
 
263 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.05 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.99 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  33.03 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.42 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  28.03 
 
 
229 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  34.96 
 
 
227 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  29.83 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  33.62 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
254 aa  72.4  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.58 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  32.06 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  23.77 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  24.02 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  24.78 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  25.48 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  30.16 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  29.46 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  32.5 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.06 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  30.96 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  30.6 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  22.5 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  34.91 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  32.07 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  25 
 
 
230 aa  65.1  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  25.94 
 
 
245 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  33.51 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  23.21 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  35.02 
 
 
235 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  22.37 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  30.2 
 
 
269 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  32.87 
 
 
242 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  27.13 
 
 
233 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
247 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  22.52 
 
 
219 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  30.49 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  29.91 
 
 
227 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  31.67 
 
 
241 aa  62.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 
245 aa  62.4  0.000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 
271 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  31.56 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  31.97 
 
 
246 aa  61.6  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
242 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  28.19 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  31.65 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0152  amidophosphoribosyltransferase-like protein  22.03 
 
 
238 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0150126  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  31.19 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  28.05 
 
 
233 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  32.74 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  29.87 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  28.4 
 
 
255 aa  60.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  28.19 
 
 
262 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  35.14 
 
 
207 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1942  phosphoribosyltransferase  26.98 
 
 
247 aa  59.7  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  33.82 
 
 
299 aa  59.7  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.34 
 
 
233 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.89 
 
 
238 aa  59.3  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  31.36 
 
 
251 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 
239 aa  58.9  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  29.22 
 
 
232 aa  58.9  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  24.32 
 
 
243 aa  58.9  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  38.71 
 
 
271 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  28.95 
 
 
233 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  29.92 
 
 
255 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>