175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1852 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1852  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 244 aa  457  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1762  amidophosphoribosyltransferases-like  44.92 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1079  hypothetical protein  37.95 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 		 282 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1415  phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 268 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137612  normal  0.0133678 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0970  hypothetical protein  36.64 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30910  predicted amidophosphoribosyltransferase  38.25 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.833734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0907  hypothetical protein  37.98 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0773  phosphoribosyltransferase  39.73 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  32.44 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2709  phosphoribosyltransferase  36.58 
 
 		 308 aa  78.6  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7591  hypothetical protein  38.96 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.142223 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08620  predicted amidophosphoribosyltransferase  35.9 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.133544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13271  hypothetical protein  37.04 
 
 		 213 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.999438  normal  0.247465 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2493  hypothetical protein  39.77 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.213195  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  36.72 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  27.8 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4040  phosphoribosyltransferase  39.08 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1385  hypothetical protein  36.44 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.653561  normal  0.716012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  37.84 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3741  phosphoribosyltransferase  37.79 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.15 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  25.81 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14720  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.44 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.43829  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 255 aa  68.6  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0763  amidophosphoribosyltransferases-like  35.04 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.040475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  25.35 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0595  hypothetical protein  26.56 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  30.99 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1351  hypothetical protein  35.56 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.163602  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1369  hypothetical protein  35.56 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  28.81 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  32.32 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.97 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  32.22 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1436  hypothetical protein  37.36 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  26.19 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  27.01 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  28.87 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  31.4 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4282  phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  30.74 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  32 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1760  hypothetical protein  35.68 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101883 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  25.21 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.72 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  34.72 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.03 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1824  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.14 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  22.22 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  29.75 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  33.18 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4707  hypothetical protein  36.19 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978047 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  24.38 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  33.65 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  25 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  33.7 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0828  putative competence protein F  21.23 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.173403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  25.34 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  30.89 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  27.49 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  21.39 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  30.41 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  21.39 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  23.97 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  25.32 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  29.96 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  32.53 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  29.96 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  30.6 
 
 		 256 aa  55.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  30.12 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  29.01 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  23.58 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  27.78 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.55 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  27.66 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0152  amidophosphoribosyltransferase-like protein  19.44 
 
 		 238 aa  53.5  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0150126  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  33.33 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3630  phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  24.46 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.57 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 		 271 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  30.17 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1776  competence protein F, putative  35.53 
 
 		 239 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  35.51 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  27.92 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  32.24 
 
 		 230 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  44.93 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  26.2 
 
 		 229 aa  52  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>