263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1211 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  535  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  52.23 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  47.41 
 
 		 230 aa  193  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.25 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  36.09 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.92 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  36.8 
 
 		 242 aa  92.4  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  37.4 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.21 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  30.83 
 
 		 233 aa  85.9  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  36.29 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  32.19 
 
 		 241 aa  85.5  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  29.34 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  32.19 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  31.25 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  25.35 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  35.15 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  32.37 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  29.2 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  29.66 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  36.29 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.63 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  34.31 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  36.21 
 
 		 253 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  34.75 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.2 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  30.86 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  33.85 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.86 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  26.58 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  23.31 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  22.98 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  33.89 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  26.75 
 
 		 231 aa  72  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  31.7 
 
 		 239 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  34.04 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  33.83 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  27.2 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.98 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4395  ComF family protein  36.91 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  34.73 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  31.47 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  29.8 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  26.16 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  29.61 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  31.48 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  29.96 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  29 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  29.24 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  30 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  30.38 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  31.91 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.38 
 
 		 215 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  25.43 
 
 		 221 aa  67  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  41.55 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  33.74 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  24.67 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  33.62 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  32.23 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  28.09 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  24.58 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  22.84 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0828  putative competence protein F  22.34 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.173403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  33.05 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20620  predicted amidophosphoribosyltransferase  36.42 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.235414  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  28.39 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  20.87 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  27.51 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1812  phosphoribosyltransferase  19.91 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  25 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  24.31 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  25 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  28.16 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  33.06 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  27.48 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  24.23 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  35.23 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  30.74 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  24.23 
 
 		 234 aa  62  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  25.53 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  29.53 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  25.35 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  31.53 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  33.61 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>