287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2181 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  44.59 
 
 
230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  41.89 
 
 
239 aa  186  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  44.8 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  40 
 
 
228 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  44 
 
 
237 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  41.55 
 
 
233 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  39.38 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  37.83 
 
 
242 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  36.56 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  34.68 
 
 
234 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  34.68 
 
 
234 aa  143  3e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  35.87 
 
 
243 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.93 
 
 
238 aa  141  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  36.28 
 
 
243 aa  138  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
246 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  38.01 
 
 
231 aa  132  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.08 
 
 
243 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  33.04 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  35.48 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  35.09 
 
 
241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  33.07 
 
 
296 aa  128  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  35.43 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  33.91 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  38.43 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  37.67 
 
 
238 aa  126  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  34.23 
 
 
244 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  34.55 
 
 
263 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  34.55 
 
 
237 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  32.05 
 
 
245 aa  125  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  34.76 
 
 
255 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  34.07 
 
 
244 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  34.53 
 
 
241 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  33.03 
 
 
227 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 
239 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  32.35 
 
 
230 aa  123  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 
271 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 
270 aa  122  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 
259 aa  122  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.6 
 
 
246 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 
258 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  35.48 
 
 
241 aa  122  6e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  34.31 
 
 
247 aa  121  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  34.07 
 
 
230 aa  121  9e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.93 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  31.51 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.93 
 
 
258 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 
239 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  35.24 
 
 
231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  36.59 
 
 
247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  33.63 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  35.57 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  33.63 
 
 
233 aa  118  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  36.89 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  31.39 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  33.62 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.57 
 
 
230 aa  116  3e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  35.4 
 
 
238 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  31.8 
 
 
233 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.08 
 
 
233 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  35.45 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 
248 aa  114  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  31.78 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  34.05 
 
 
240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  32.72 
 
 
233 aa  112  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0504  putative competence protein  36.24 
 
 
255 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0669  ComF family protein  36.24 
 
 
255 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0486  putative competence protein  36.24 
 
 
255 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
261 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  33.04 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  34.93 
 
 
261 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 
264 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  33.19 
 
 
241 aa  112  5e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  31.56 
 
 
229 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 
271 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3200  ComF family protein  35.81 
 
 
242 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0173  ComF family protein  35.81 
 
 
255 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1419  ComF family protein  35.81 
 
 
255 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2846  ComF family protein  35.81 
 
 
255 aa  111  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  34.19 
 
 
255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  32.61 
 
 
255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  31.84 
 
 
239 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  32.89 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  31.17 
 
 
253 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  30.25 
 
 
242 aa  109  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  33.48 
 
 
271 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  32.75 
 
 
241 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  32.33 
 
 
266 aa  108  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  33.77 
 
 
232 aa  108  9.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  35.1 
 
 
251 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  34.63 
 
 
249 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  29.39 
 
 
220 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
217 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 
254 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 
269 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  30.4 
 
 
231 aa  106  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>