More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3081 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 237 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  42.08 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  39.15 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  41.98 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  40.59 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  42.46 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  38.5 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  36.68 
 
 		 229 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  40.2 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.31 
 
 		 258 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.55 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.63 
 
 		 258 aa  134  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  36.19 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  39.05 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  36.75 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  34.78 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 		 213 aa  129  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  35.06 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 		 245 aa  126  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  35.68 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  37.85 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  34.2 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.62 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  39.81 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  36.93 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  34.82 
 
 		 234 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  36.67 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  35.27 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  32.03 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  40.33 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  36.23 
 
 		 262 aa  121  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  33.47 
 
 		 249 aa  120  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  31.28 
 
 		 245 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  37.96 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  36.93 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  36.23 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  36.23 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  35.38 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  39.23 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  39.15 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  35.71 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  37.39 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  35.93 
 
 		 246 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  34.07 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  33.02 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  34.98 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  36.96 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  32.38 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  36.86 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  37.19 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  32.56 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  33.2 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  36.24 
 
 		 260 aa  114  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  36.77 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  37.38 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.04 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  34.25 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  35.02 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  35.54 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  35.51 
 
 		 262 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  27.63 
 
 		 270 aa  112  6e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  34.5 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  34.93 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  32.66 
 
 		 230 aa  111  9e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  30.33 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  36.82 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  35.43 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  30.17 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.74 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  38.22 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  35.32 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  37.66 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  30.57 
 
 		 266 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  29.86 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  33.04 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  32.6 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  32.93 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  31.44 
 
 		 240 aa  104  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  34.75 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  36.17 
 
 		 235 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  33.95 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  36.64 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  32.16 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  34.75 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  31.76 
 
 		 226 aa  104  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  31.74 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  34.38 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>