More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1322 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
226 aa  468  1.0000000000000001e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  41.67 
 
 
224 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  36.09 
 
 
230 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.99 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  36.29 
 
 
235 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  34.23 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  33.76 
 
 
234 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  33.76 
 
 
234 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  33.33 
 
 
234 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  33.33 
 
 
234 aa  128  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  35.87 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  33.33 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  32.49 
 
 
234 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  35.9 
 
 
190 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  36.41 
 
 
190 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  36.41 
 
 
190 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0407  late competence protein  30.63 
 
 
220 aa  113  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00143489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  34.87 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  35.11 
 
 
190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  30.87 
 
 
223 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  29.78 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
259 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0792  hypothetical protein  30.17 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0624142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0775  hypothetical protein  30.17 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.572704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  29.49 
 
 
242 aa  89.7  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0418  comF operon protein 3  28.7 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  25.86 
 
 
243 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 
242 aa  85.9  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 
242 aa  85.5  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  27.32 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  30.1 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  27.43 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  25.96 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  26.86 
 
 
251 aa  81.6  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.67 
 
 
237 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  26.59 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  27.7 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  24.89 
 
 
243 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  26.45 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  26.76 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.45 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  26.34 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.6 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  26.34 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  26.6 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  26.29 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  24.55 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.92 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.46 
 
 
243 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.78 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  25.74 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  32.56 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  26.98 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  26.7 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  24.36 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  27.01 
 
 
233 aa  72  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  26.73 
 
 
247 aa  72  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  26.17 
 
 
255 aa  72  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  27.75 
 
 
242 aa  72  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  24.41 
 
 
255 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  27.1 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  24.39 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  23.85 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  31.46 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  27.1 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  26.27 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.79 
 
 
215 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  25.23 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  25.21 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.87 
 
 
246 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  23.53 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  29.44 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  23.81 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  22.12 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1942  phosphoribosyltransferase  25.22 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  24.09 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1671  ComF family protein  26.41 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  27.7 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  26.42 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  23.83 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  25.12 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  24.31 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  25.23 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  28.93 
 
 
219 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  22.38 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  24.54 
 
 
245 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  23.53 
 
 
253 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  22.79 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  25.45 
 
 
269 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
220 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  21.86 
 
 
255 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  22.73 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  26.15 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  25.35 
 
 
247 aa  63.2  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>