More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1679 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  33.04 
 
 		 255 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  32.3 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  32.74 
 
 		 255 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  31.7 
 
 		 253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31.03 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 259 aa  115  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  31.8 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  29.74 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  30.04 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.63 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  31.05 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  29.83 
 
 		 269 aa  108  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  29.88 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  29.41 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  29.86 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.41 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  33.49 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.43 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  31.88 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.17 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  30.04 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.67 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.02 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  27.69 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.69 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 271 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  33.33 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  29.07 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  30.47 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  28.71 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  28.57 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  28.77 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.31 
 
 		 296 aa  99.8  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 279 aa  98.6  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  28.07 
 
 		 270 aa  98.6  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 		 260 aa  97.4  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  29.28 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  29.26 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 279 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  27.47 
 
 		 251 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.25 
 
 		 254 aa  95.1  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  27.03 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.7 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  27.7 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  28.23 
 
 		 268 aa  94.4  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  28.88 
 
 		 262 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  32.11 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  27.88 
 
 		 263 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  27.88 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  27.88 
 
 		 267 aa  90.5  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  28.57 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.67 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 264 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  27.35 
 
 		 262 aa  88.6  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 202 aa  88.6  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 246 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 202 aa  88.6  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 		 245 aa  88.2  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  26.86 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  27.91 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  24.46 
 
 		 230 aa  86.3  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  28.64 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  28.43 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  27.75 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  31.66 
 
 		 208 aa  85.1  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  26.46 
 
 		 243 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  26.7 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  29.77 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  30.49 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  25.11 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  26.18 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  26.38 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  27.16 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  28.63 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  29.31 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  23.91 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.21 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  30.4 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>