274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4601 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  100 
 
 		 239 aa  447  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  44.14 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 		 259 aa  118  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  38.03 
 
 		 243 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  39.66 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  39.82 
 
 		 248 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  35.06 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  35.53 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.84 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.84 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  27.39 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  32.31 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.16 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  36.64 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.64 
 
 		 258 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.18 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 		 254 aa  95.5  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  34.19 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  30.18 
 
 		 226 aa  95.5  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.22 
 
 		 258 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  33.33 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  37.18 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  36.67 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  36.8 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  41.82 
 
 		 238 aa  94.4  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  37.34 
 
 		 262 aa  92.4  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  29.69 
 
 		 233 aa  92.4  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 269 aa  91.7  9e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  36.67 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  27.83 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  37.78 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  37.66 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  27.68 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.4 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  33.62 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  27.68 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  37.1 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  37.5 
 
 		 244 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  33.62 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  34.63 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  37 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  27.68 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  32.9 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  37.07 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  25.83 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  36 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  34.85 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  34.16 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  34.73 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  40.35 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  31.22 
 
 		 232 aa  87  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 		 246 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  39.52 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  37.83 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  38.81 
 
 		 207 aa  85.5  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  35.63 
 
 		 271 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  25.55 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  37.72 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  38.18 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  34.96 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.28 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  36.21 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  30.23 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  34.33 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  34.33 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  36.15 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  37.89 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  30.8 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  34.32 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  30.4 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  38.41 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.6 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  27.52 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  33.17 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  27.98 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  28.75 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  34.7 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.77 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  32.05 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  44.17 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  24.15 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  33.33 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  24.89 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  35.78 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  34.71 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  34.38 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  22.22 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0972  comF-related protein  28.18 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.402325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>