More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2264 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
255 aa  510  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  45.89 
 
 
236 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  45.34 
 
 
258 aa  181  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 
215 aa  175  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  41.74 
 
 
270 aa  175  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  43.39 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 
246 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  38.49 
 
 
258 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  38.49 
 
 
258 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  40.65 
 
 
264 aa  165  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  41.74 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  44.64 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
254 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  43.7 
 
 
272 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.49 
 
 
230 aa  155  4e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  39.92 
 
 
255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  41.15 
 
 
255 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  38.49 
 
 
262 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  39.42 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  43.78 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  40.16 
 
 
248 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  39.3 
 
 
242 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  39.24 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  38.96 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  41.1 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  38.56 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  39.92 
 
 
255 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.34 
 
 
230 aa  142  4e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  41.91 
 
 
258 aa  142  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
260 aa  141  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  40.18 
 
 
217 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.92 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  35.74 
 
 
240 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  36.64 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  37.5 
 
 
238 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 
242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  36.17 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  36.48 
 
 
251 aa  133  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  38.14 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.47 
 
 
240 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  35.19 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  35.89 
 
 
245 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
239 aa  125  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 
244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  35.55 
 
 
246 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  39.24 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  35.05 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  39.26 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
247 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.49 
 
 
246 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  32.26 
 
 
270 aa  112  4.0000000000000004e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  33.19 
 
 
231 aa  109  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2585  competence protein F  36.82 
 
 
245 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  34.51 
 
 
233 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  40.29 
 
 
238 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.02 
 
 
245 aa  106  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  37.26 
 
 
279 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
233 aa  106  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  36.28 
 
 
213 aa  105  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  37.25 
 
 
243 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  34.19 
 
 
258 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  38.05 
 
 
247 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.27 
 
 
243 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  38.83 
 
 
262 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  31.84 
 
 
244 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  31.88 
 
 
227 aa  101  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  37.82 
 
 
268 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  38.98 
 
 
237 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 
242 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  33.19 
 
 
245 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  36.67 
 
 
227 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  31.14 
 
 
233 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  34.17 
 
 
249 aa  99  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  31.86 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  37.81 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  33.17 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  34.94 
 
 
239 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  33.33 
 
 
241 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  34.5 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  26.92 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  26.92 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  38 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  36.76 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.35 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  36.67 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  28.32 
 
 
273 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  36.67 
 
 
227 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  36.67 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  36.67 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  36.67 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  36.67 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  30.7 
 
 
232 aa  95.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  31.86 
 
 
230 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  36.19 
 
 
227 aa  94.4  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>