More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4754 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
276 aa  570  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
229 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  36.94 
 
 
259 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  36.09 
 
 
243 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  36.96 
 
 
242 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  34.12 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  37.78 
 
 
242 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  34.39 
 
 
251 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 
239 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.47 
 
 
233 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  34.39 
 
 
233 aa  105  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  33.2 
 
 
233 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  35.44 
 
 
271 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  32.75 
 
 
249 aa  103  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  32.1 
 
 
238 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  32.13 
 
 
270 aa  102  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  31.67 
 
 
227 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  34.48 
 
 
240 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  37.36 
 
 
255 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  37.79 
 
 
213 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  34.38 
 
 
240 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  37.36 
 
 
255 aa  99  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
245 aa  98.6  9e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  32.44 
 
 
271 aa  98.6  9e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  30.4 
 
 
239 aa  98.6  9e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36 
 
 
215 aa  98.6  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  31.65 
 
 
230 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  33.33 
 
 
238 aa  97.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  38.1 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
220 aa  97.8  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  32.39 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  33.48 
 
 
230 aa  95.5  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
279 aa  95.5  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  31.65 
 
 
268 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  35.78 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  33.19 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  31.56 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.12 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.77 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  33.33 
 
 
268 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  32.08 
 
 
230 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  31.27 
 
 
261 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
227 aa  93.2  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  33.49 
 
 
268 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  32.59 
 
 
228 aa  92.4  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
243 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  32.68 
 
 
219 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  29.26 
 
 
270 aa  92  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.33 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  28.37 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  32.09 
 
 
233 aa  91.3  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  42.61 
 
 
272 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  30.56 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  33.02 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31.3 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  30.81 
 
 
226 aa  90.5  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  32.29 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  32.78 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  29.83 
 
 
296 aa  90.1  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  36.22 
 
 
299 aa  89.7  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 
246 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  35.48 
 
 
269 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  33.18 
 
 
241 aa  89  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  33.02 
 
 
207 aa  89  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  34.42 
 
 
263 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  32.72 
 
 
266 aa  89  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  35.12 
 
 
253 aa  89  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  34.52 
 
 
255 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  31.96 
 
 
237 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  34.2 
 
 
242 aa  89  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.87 
 
 
238 aa  88.6  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  30.31 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  30.17 
 
 
236 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  34.76 
 
 
231 aa  88.6  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 
232 aa  88.2  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  41.74 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  33.64 
 
 
249 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  32.11 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 
220 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  31.05 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  35.02 
 
 
232 aa  87.8  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  36.84 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  31.8 
 
 
252 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  32.47 
 
 
243 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0232  competence protein F  39.19 
 
 
280 aa  87  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  31.12 
 
 
235 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  34.84 
 
 
250 aa  86.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  33.2 
 
 
241 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  33.77 
 
 
274 aa  85.9  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  34.06 
 
 
263 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  36.09 
 
 
267 aa  85.5  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  33.49 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  32.22 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1671  ComF family protein  33.79 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>