297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2296 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  478  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  39.57 
 
 
230 aa  144  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  42.79 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  32.89 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  32.46 
 
 
234 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  37.04 
 
 
246 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  37.61 
 
 
233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  40.42 
 
 
241 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  38.33 
 
 
241 aa  131  9e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  38.33 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  40.76 
 
 
262 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.66 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  39.82 
 
 
243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  39.11 
 
 
241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  39.37 
 
 
243 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.13 
 
 
246 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
244 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  41.13 
 
 
238 aa  122  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  35.48 
 
 
227 aa  122  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  39.91 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  31.98 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 
246 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  38.34 
 
 
231 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  34.09 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 
259 aa  119  6e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  31.27 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  34.44 
 
 
244 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  39.58 
 
 
238 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
247 aa  115  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  35.93 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  37.17 
 
 
228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  41.85 
 
 
258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  31.28 
 
 
232 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  34.32 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
229 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  39.38 
 
 
230 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  36.33 
 
 
243 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.36 
 
 
215 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  39.43 
 
 
299 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.03 
 
 
250 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  31.14 
 
 
274 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  38.96 
 
 
242 aa  105  7e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35.74 
 
 
242 aa  105  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  38.96 
 
 
242 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  38.21 
 
 
247 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  36.96 
 
 
255 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  29.96 
 
 
268 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  37.23 
 
 
238 aa  103  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  40.09 
 
 
238 aa  102  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  32.48 
 
 
250 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  29.96 
 
 
268 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  33.82 
 
 
227 aa  101  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  34.25 
 
 
247 aa  101  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  31.54 
 
 
266 aa  100  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  33.47 
 
 
286 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  33.73 
 
 
258 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  38.6 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  29.22 
 
 
204 aa  99.8  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  37.82 
 
 
240 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  31.95 
 
 
237 aa  99  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 
239 aa  99  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.65 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  31.95 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  29.55 
 
 
262 aa  98.6  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  37.56 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0243  competence protein ComF  32.63 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 
217 aa  96.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  34.08 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  29.65 
 
 
233 aa  95.9  5e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  37.01 
 
 
268 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  30.49 
 
 
263 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  30.49 
 
 
263 aa  95.5  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  30.49 
 
 
263 aa  95.1  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  27.21 
 
 
293 aa  95.1  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  33.18 
 
 
251 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  34.22 
 
 
261 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  38.76 
 
 
239 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  30.04 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  35.55 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  29.78 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  30.49 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.42 
 
 
258 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  36.51 
 
 
255 aa  92.8  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  34.84 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.42 
 
 
258 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2857  phosphoribosyltransferase  40.56 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  35.94 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  37.55 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  31.17 
 
 
233 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  36.09 
 
 
274 aa  91.3  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  34.96 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 
255 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  26.54 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  27.9 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  48.7 
 
 
118 aa  90.5  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 
237 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.61 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>