More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2248 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  41.3 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  30.34 
 
 		 243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 		 242 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 259 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  33.04 
 
 		 226 aa  121  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  30.8 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.33 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 		 213 aa  118  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  29.91 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  29.95 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  31.11 
 
 		 251 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  31.25 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.04 
 
 		 233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  32.17 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  32.33 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  28.38 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  31.39 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  28.57 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  31.84 
 
 		 279 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  31.74 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  28.57 
 
 		 255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  30.33 
 
 		 204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  34.1 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  31.34 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.31 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  29.74 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  31.03 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  28.83 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  36.21 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  27.44 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.34 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 247 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  28.14 
 
 		 256 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  33.51 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 270 aa  101  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  27.75 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 		 261 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  28.77 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  34.29 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  28.05 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  28.89 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  29.82 
 
 		 261 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  30 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  27.71 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  30.99 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  27.27 
 
 		 244 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  26.92 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  30.51 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  30.97 
 
 		 246 aa  99.4  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  26.72 
 
 		 241 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  28.14 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2767  phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 270 aa  98.6  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  28.97 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 246 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  27.68 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  27.78 
 
 		 286 aa  97.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  32.61 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  28.38 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  25.85 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  30.41 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  32.26 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  28.64 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  32.47 
 
 		 270 aa  95.5  5e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  32.93 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  32.24 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2905  phosphoribosyltransferase  28.7 
 
 		 270 aa  94.7  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  32.86 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  27.91 
 
 		 299 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  29.18 
 
 		 240 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  28.98 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  28.07 
 
 		 262 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  30.1 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  27.15 
 
 		 241 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  27.31 
 
 		 226 aa  92.8  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  27.12 
 
 		 246 aa  92.8  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 		 269 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  26.7 
 
 		 242 aa  92.4  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  28.08 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  28.08 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>