More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1405 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  100 
 
 		 256 aa  511  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  39.84 
 
 		 255 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  37.85 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  37.56 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  31.9 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  36.67 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  36.84 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  34.33 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  33.62 
 
 		 226 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  33.63 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  36.44 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  37.13 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  36.93 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  37.34 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  36.14 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.41 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 		 230 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  35.1 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  46.9 
 
 		 215 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  38.03 
 
 		 259 aa  105  9e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  47.37 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  36.7 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 271 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  33.63 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  36.5 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  44.3 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  35.44 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  35.25 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.02 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  41.5 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  43.42 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  34.62 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  43.62 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  42.03 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  38.53 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  38.41 
 
 		 258 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  34.78 
 
 		 262 aa  99  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  31.36 
 
 		 229 aa  99  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  36.51 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 		 230 aa  97.8  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  34.76 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  37.55 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  47.54 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 		 230 aa  96.7  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  42.14 
 
 		 213 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.18 
 
 		 206 aa  95.9  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.34 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  45.67 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  42.29 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.47 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  42.95 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  34.58 
 
 		 251 aa  93.2  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  37.38 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  43.61 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  28.25 
 
 		 226 aa  92  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  32.29 
 
 		 271 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  33.33 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  25.44 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  39.41 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  49.59 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  34.16 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  35.15 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  42.28 
 
 		 261 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  44.53 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  41.22 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  34.36 
 
 		 262 aa  88.6  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  34.26 
 
 		 243 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  41.25 
 
 		 271 aa  88.6  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1812  phosphoribosyltransferase  23.25 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  36.73 
 
 		 234 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  42.38 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  23.25 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  36.48 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  33.33 
 
 		 240 aa  87.8  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  34.93 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  32.55 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  36.73 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  34.78 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  36.89 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  40.94 
 
 		 261 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.75 
 
 		 238 aa  85.5  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  30.31 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  42.45 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  33.62 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>