280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1381 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  100 
 
 		 229 aa  474  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  42.22 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  36.77 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.75 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  35.65 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  33.48 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  30.09 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  31.16 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  33.05 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  31.34 
 
 		 253 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.92 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  28.85 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  26.91 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  29.57 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 245 aa  88.6  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  29.39 
 
 		 269 aa  88.2  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  31.41 
 
 		 256 aa  88.2  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  28.02 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 		 259 aa  87.8  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.02 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  28.04 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  30.61 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 270 aa  85.5  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  26.22 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  29.7 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  30.95 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  27.19 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  29.38 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.84 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.31 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  24.03 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  25.33 
 
 		 243 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  28.78 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  27.43 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  28.57 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  30.06 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  27.43 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  28.31 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  25.96 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  28.04 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.19 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  29.3 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 		 217 aa  75.9  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  29.67 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  33.6 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  27.78 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  29.95 
 
 		 273 aa  75.1  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  26.09 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  24.68 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  31.13 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  28.77 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  32.35 
 
 		 240 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  30.87 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  25.23 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  27.57 
 
 		 262 aa  72  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  30.14 
 
 		 251 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  25.52 
 
 		 249 aa  72  0.000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  29.38 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  29.38 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  28.57 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  30.53 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  31.25 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  25.22 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2548  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.17 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.93 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  26.54 
 
 		 246 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  25.35 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  23.9 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  28.02 
 
 		 276 aa  68.2  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  25.32 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  29.33 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  26.17 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  25.32 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  29.01 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  25.95 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>