248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0998 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1648  phosphoribosyltransferase  51.72 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  39.8 
 
 		 207 aa  113  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.98 
 
 		 229 aa  96.7  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  37.91 
 
 		 226 aa  84.7  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  37.25 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.37 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  32.23 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  31.07 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  34.95 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  31.3 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.04 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  32.18 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  27.01 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  33.98 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  38.59 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  31.13 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  35.57 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  30.22 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  32.56 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.18 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  33.67 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 		 276 aa  72  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  33.83 
 
 		 274 aa  68.2  0.00000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  32.38 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  34.95 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  33.82 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  32.84 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  33.16 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  29.29 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  32.55 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  31.53 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  31.53 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  32.16 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  30.46 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 		 239 aa  65.1  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  30.62 
 
 		 259 aa  64.7  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  29.35 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.88 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  31.07 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  29.35 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  31.53 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  35.33 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 		 237 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  23.27 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  27 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  25.13 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  29.44 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  30.22 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31.79 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  26.11 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  26.11 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  40.95 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  29.19 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  26 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  27.18 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  35.52 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  31.28 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  30.65 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  28.42 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  29.53 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  29.44 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.98 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  32.61 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3200  ComF family protein  33.17 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  32.61 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  38.46 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0173  ComF family protein  33.17 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1419  ComF family protein  33.17 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2846  ComF family protein  33.17 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  32.07 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  38.1 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  23.96 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.99 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  28.72 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  28.65 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  29.68 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  33.16 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  32.11 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  27.37 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  30.8 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0669  ComF family protein  32.66 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  29.67 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  33.09 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2857  phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 274 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>