More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0090 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  43.58 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  32.57 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.42 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  31 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  30.7 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  33.18 
 
 		 251 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  31.78 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  36.42 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  27.52 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  29.39 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  31.92 
 
 		 242 aa  105  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  30.66 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  28.76 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.07 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  32.56 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  26.46 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  28.37 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  25.33 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  34.44 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.31 
 
 		 215 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.74 
 
 		 296 aa  99  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.69 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  28.7 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  29.46 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  28.7 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  28.51 
 
 		 255 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  26.73 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  30.36 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.07 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  29.96 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  28.57 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  29.78 
 
 		 244 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  29.2 
 
 		 246 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  27.6 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  35.85 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  33.49 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  30.94 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  30.09 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  26.79 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  25.22 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  28.19 
 
 		 255 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  27.15 
 
 		 226 aa  91.3  9e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  29.69 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  31.93 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  28.96 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  25.86 
 
 		 255 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  31.01 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  27.6 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.33 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  28.37 
 
 		 286 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  36.57 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  27.43 
 
 		 271 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  34.59 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  27.83 
 
 		 262 aa  89.4  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  31.4 
 
 		 236 aa  89  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  26.87 
 
 		 240 aa  89  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  27.14 
 
 		 238 aa  88.6  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  27.94 
 
 		 279 aa  88.6  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  28.07 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  27.5 
 
 		 247 aa  88.2  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  27.27 
 
 		 256 aa  88.2  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  27.19 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 		 276 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  30.37 
 
 		 221 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  29.02 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  36.5 
 
 		 256 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  30.29 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  25.31 
 
 		 270 aa  87  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  32.34 
 
 		 255 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  27.43 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  26.85 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  28.44 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  26.01 
 
 		 248 aa  85.9  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  28.96 
 
 		 246 aa  85.5  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  27.19 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  31.66 
 
 		 217 aa  85.1  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 		 246 aa  85.1  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  28.5 
 
 		 247 aa  84.7  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  28.7 
 
 		 255 aa  84.7  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  26.85 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  28.12 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  26.91 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  25.45 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1776  competence protein F, putative  30.24 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  27.83 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  34.87 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  27.43 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>