279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0541 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 261 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  86.97 
 
 		 261 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  67.66 
 
 		 268 aa  340  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  69.36 
 
 		 255 aa  299  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0486  putative competence protein  68.09 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0669  ComF family protein  68.09 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0504  putative competence protein  68.09 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3200  ComF family protein  68.09 
 
 		 242 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1419  ComF family protein  68.09 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2846  ComF family protein  68.09 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0173  ComF family protein  68.09 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2767  phosphoribosyltransferase  62.4 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  64.5 
 
 		 257 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2905  phosphoribosyltransferase  62.4 
 
 		 270 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6179  phosphoribosyltransferase  61.73 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2861  phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.603337 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2236  phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 266 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2850  phosphoribosyltransferase  60 
 
 		 265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  46.89 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  46.06 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  44.18 
 
 		 279 aa  158  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  44.98 
 
 		 222 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  46.32 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  39.22 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  39.66 
 
 		 266 aa  138  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  38.17 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  35.02 
 
 		 296 aa  135  9e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  40.16 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  36.93 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  40.52 
 
 		 241 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  40.26 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.93 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  39.75 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  35.62 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  35.77 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  35.77 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  37.29 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  37.44 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  35.45 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  39.65 
 
 		 241 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  35.45 
 
 		 234 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  36.4 
 
 		 228 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  35.81 
 
 		 246 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  42.36 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  36.93 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  37.39 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  38.04 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  36.09 
 
 		 227 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  34.62 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  35.62 
 
 		 227 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  35.62 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  35.89 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  31.25 
 
 		 204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1671  ComF family protein  36.69 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.93 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  35.98 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  35.19 
 
 		 227 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  38.63 
 
 		 230 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  34.35 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  33.77 
 
 		 227 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  35.19 
 
 		 227 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  33.77 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  35.56 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  33.33 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  33.77 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1942  phosphoribosyltransferase  29.84 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  33.33 
 
 		 227 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  29.28 
 
 		 293 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  33.91 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  35.95 
 
 		 258 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  34.63 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  37.34 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  33.33 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.03 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 		 242 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  35.44 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  29.82 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  36.36 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  36.16 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  35.62 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.4 
 
 		 229 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  35.5 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.6 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.38 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  36.64 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  33.33 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  33.33 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.38 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  33.19 
 
 		 230 aa  98.2  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  30.99 
 
 		 286 aa  95.9  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  51.3 
 
 		 118 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  35.84 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  33.66 
 
 		 233 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  34.56 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>