223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1648 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1648  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 206 aa  415  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  51.72 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  35.27 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.32 
 
 		 229 aa  88.6  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  29.09 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  29.7 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  38.32 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  28.64 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.66 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  27.18 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  33.16 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  21.08 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  33.5 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  26.4 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.19 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1247  phosphoribosyltransferase  24.26 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  29.39 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  29.17 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1208  phosphoribosyltransferase  24.26 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195663  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  31.82 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  27.98 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  36.88 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  31.9 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  27.91 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  27.36 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  35.92 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  30.1 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  25.74 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  30.46 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  29.17 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  34.97 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0186  comFC protein, putative  24.12 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.55 
 
 		 698 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  32.46 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  33.94 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.23 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  26.7 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  29.65 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  29.95 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  31.78 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0828  putative competence protein F  23.96 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.173403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  35.46 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  26.73 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  29.06 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  25.89 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  32.56 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  33.94 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  27.41 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  27.75 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  26.55 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  29.15 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  26.77 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  31.4 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  26.76 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  31.94 
 
 		 249 aa  57  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  22.97 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  24.89 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0152  amidophosphoribosyltransferase-like protein  21.94 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0150126  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  29.5 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  31.03 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  40.95 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  31.47 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  25.35 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12410  predicted amidophosphoribosyltransferase  30.19 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  39 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  25.35 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  25.5 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  28.06 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  30.3 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  27.84 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  39.47 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0418  comF operon protein 3  23.39 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.95 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.5 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  28.06 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3749  gluconate periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  30.35 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  29.02 
 
 		 249 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0164  gluconate periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  27.42 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  25.99 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3989  gluconate periplasmic binding protein  28.16 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0985  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.39 
 
 		 249 aa  52.8  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  29.38 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  38.18 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  31.75 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  36.73 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  24.88 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>