125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0418 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0418  comF operon protein 3  100 
 
 		 224 aa  465  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0775  hypothetical protein  55.56 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.572704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0792  hypothetical protein  55.56 
 
 		 224 aa  250  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0624142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  31.03 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.3 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  30.6 
 
 		 234 aa  98.6  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  32.68 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  30.9 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  28.7 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  32.98 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  31.02 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  32.98 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 216 aa  85.1  8e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  28.51 
 
 		 234 aa  84.7  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  32.45 
 
 		 190 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  28.88 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  30.62 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  34.23 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  29.17 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  32 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  27.78 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0407  late competence protein  30.97 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00143489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  30.19 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  31.54 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.97 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  26.64 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  27.55 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  27.27 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  26.12 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  30.57 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  27.19 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  22.54 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  29.79 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  28.03 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  30.85 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  22.79 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  28.41 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1648  phosphoribosyltransferase  23.39 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  24.66 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  23.43 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  26.7 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  22.49 
 
 		 248 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 		 270 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  25.11 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 268 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  25.79 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  27.88 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  23.42 
 
 		 247 aa  52.4  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  26.57 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.45 
 
 		 258 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  23.08 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  22.83 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  24.16 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  23.12 
 
 		 279 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  25.97 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 		 271 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.83 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  25.66 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  24.39 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  24.71 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  24.09 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  24.15 
 
 		 286 aa  50.1  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  24.36 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  23.38 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  23.38 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  28.95 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  23.75 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  23.9 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  27.92 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  23.44 
 
 		 247 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  23.89 
 
 		 245 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  48.5  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  22.59 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  31.62 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  23.23 
 
 		 267 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  23.04 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  23.75 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  24.86 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  21.78 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  23.04 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  23.11 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  23.42 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  23.56 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  38.24 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  22.5 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  23.16 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  38.24 
 
 		 262 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  25.16 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  24.52 
 
 		 271 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  21.76 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  30.22 
 
 		 231 aa  45.4  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.29 
 
 		 230 aa  45.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0828  putative competence protein F  23.17 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.173403  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  26.4 
 
 		 269 aa  45.1  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  25.16 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  20.49 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  22.96 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>