274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_5425 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  100 
 
 
234 aa  387  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  96.32 
 
 
234 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  95.24 
 
 
234 aa  366  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  84.74 
 
 
190 aa  336  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  84.21 
 
 
234 aa  333  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  83.16 
 
 
190 aa  327  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  82.63 
 
 
190 aa  326  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  75.13 
 
 
234 aa  298  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  62.23 
 
 
234 aa  249  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  49.47 
 
 
230 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  45.26 
 
 
235 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  36.41 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  38.42 
 
 
224 aa  113  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  36.57 
 
 
216 aa  105  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.69 
 
 
226 aa  104  9e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  36.84 
 
 
221 aa  102  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0407  late competence protein  37.06 
 
 
220 aa  92.4  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00143489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
229 aa  89  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  36.46 
 
 
242 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  32.43 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.36 
 
 
245 aa  87  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0418  comF operon protein 3  32.98 
 
 
224 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  33.85 
 
 
259 aa  86.3  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  36.31 
 
 
242 aa  84.7  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  31.65 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.85 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0792  hypothetical protein  31.54 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0624142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0775  hypothetical protein  31.54 
 
 
224 aa  80.5  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.572704  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  30.73 
 
 
273 aa  79.3  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  33.74 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  34.13 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  30.35 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  32.93 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  33.75 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  30.73 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.09 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  36.31 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  30 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  31.9 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  27.36 
 
 
242 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 
246 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
236 aa  71.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  30.6 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  28.83 
 
 
255 aa  71.2  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  29.56 
 
 
253 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
243 aa  71.2  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  36.64 
 
 
226 aa  71.2  0.000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  27.59 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  29.01 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  30.38 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1671  ComF family protein  28.5 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  35.29 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  29.11 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  31.12 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.25 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  27.36 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  31.48 
 
 
267 aa  68.6  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  29.38 
 
 
263 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  34.59 
 
 
235 aa  67.8  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.65 
 
 
238 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  27.86 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.63 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  33.16 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  27.22 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  29.87 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.73 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  27.12 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  29.41 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  30.77 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  30.46 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4395  ComF family protein  35.38 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  29.35 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  29.09 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  28.72 
 
 
263 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 
270 aa  64.7  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  29.63 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  30.19 
 
 
247 aa  64.7  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
272 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.49 
 
 
243 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  27.66 
 
 
232 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
271 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  28.57 
 
 
263 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  30.81 
 
 
246 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  37.39 
 
 
233 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.45 
 
 
246 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  30.92 
 
 
250 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>