269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCG9842_B5646 on replicon NC_011772
Organism: Bacillus cereus G9842



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  100 
 
 
190 aa  391  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  94.74 
 
 
190 aa  365  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  83.16 
 
 
234 aa  326  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  82.63 
 
 
190 aa  326  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  82.63 
 
 
190 aa  326  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  82.63 
 
 
234 aa  325  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  82.54 
 
 
234 aa  323  6e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  78.42 
 
 
190 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  77.89 
 
 
234 aa  310  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  74.6 
 
 
234 aa  295  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  60.64 
 
 
234 aa  235  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  46.32 
 
 
230 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  45.26 
 
 
235 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  34.87 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  36 
 
 
224 aa  108  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  35.26 
 
 
216 aa  98.2  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.09 
 
 
226 aa  97.1  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  33.16 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  35.47 
 
 
221 aa  94.4  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  33.67 
 
 
259 aa  90.5  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0407  late competence protein  36.84 
 
 
220 aa  87.8  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00143489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0418  comF operon protein 3  31.02 
 
 
224 aa  85.9  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0792  hypothetical protein  29.41 
 
 
224 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0624142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0775  hypothetical protein  29.41 
 
 
224 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.572704  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  33.7 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.85 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.23 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  31.87 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 
255 aa  77.8  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  33.16 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  35.03 
 
 
242 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  29.17 
 
 
273 aa  74.7  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.5 
 
 
237 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  29.7 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  32.35 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  32.1 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  32.79 
 
 
242 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  33.75 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  31.12 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  29.17 
 
 
247 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  29.55 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
239 aa  71.2  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  29.81 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  26.87 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.16 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  31.55 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  28.43 
 
 
242 aa  70.5  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  30.98 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  29.27 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
243 aa  68.2  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  31.06 
 
 
249 aa  67  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  31.35 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  30.91 
 
 
207 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  29.25 
 
 
226 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001878  predicted amidophosphoribosyltransferase  29.73 
 
 
180 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  30.63 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.54 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  30 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  30.97 
 
 
238 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  30.22 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  30.3 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  27.81 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  37.61 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  29.63 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.45 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  28.93 
 
 
253 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  28.48 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  32.1 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.94 
 
 
258 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  28.4 
 
 
246 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.91 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
243 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 
276 aa  64.7  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  31.5 
 
 
261 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  26.42 
 
 
230 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  27.85 
 
 
243 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 
239 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  37.61 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  30.25 
 
 
243 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  30.3 
 
 
262 aa  63.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  37.61 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  30.49 
 
 
247 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  37.61 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  37.61 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  37.61 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  37.61 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  29.31 
 
 
269 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  36.75 
 
 
227 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  28.04 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  34.34 
 
 
268 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.32 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  33.07 
 
 
296 aa  62.4  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  29.33 
 
 
251 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  35.34 
 
 
232 aa  62.4  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>