267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0248 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0248  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 		 224 aa  469  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0363  amidophosphoribosyltransferase-like protein  41.59 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1322  amidophosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.575173  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5299  comF operon protein 3  36.13 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  35.71 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  36.55 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3237  late competence protein  33.33 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  36.82 
 
 		 234 aa  135  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3729  comF operon protein 3  33.76 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016688  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1189  amidophosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0337  competence protein F, putative  31.11 
 
 		 221 aa  121  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  32.49 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1333  amidophosphoribosyltransferase  32.59 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000118049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5357  comF operon protein 3  39.77 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  38.42 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  38.42 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  36.93 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3040  late competence protein  31.93 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.796491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  36 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0407  late competence protein  33.48 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00143489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0775  hypothetical protein  33.04 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.572704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0792  hypothetical protein  33.04 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0624142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0418  comF operon protein 3  32.68 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 279 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 239 aa  88.2  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  27.78 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  26.01 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  30.05 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  26.29 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0759  hypothetical protein  27.27 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  26.19 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  24.06 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  25.55 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  25.48 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  29.71 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  26.42 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  24.53 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  24.76 
 
 		 242 aa  72  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 217 aa  72  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  27.27 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  25.5 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 242 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  30.43 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  24.06 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  27.09 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  28.11 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  30.13 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  25.11 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  27.75 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  25.84 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  26.7 
 
 		 227 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  36.97 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  29.94 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  27.15 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  28.42 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  26.75 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  26.05 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  26.29 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.58 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  27.59 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  25.69 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.48 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  25.63 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.54 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  27.78 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  29.21 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.12 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  26.57 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  27.95 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  24.22 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  26.19 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  26.24 
 
 		 246 aa  62  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  24.64 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  28.17 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  26.13 
 
 		 220 aa  62  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  27.98 
 
 		 250 aa  61.6  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  23.33 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  35.34 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  30.49 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  26.19 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1211  hypothetical protein  25 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.081938  normal  0.0534087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  28.34 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.32 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  24.65 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  25.47 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  25.58 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  24.29 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  26.79 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  25.12 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  25.58 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  22.84 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  23.7 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  25.46 
 
 		 260 aa  58.5  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  24.74 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>