More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2731 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  100 
 
 		 245 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  54.47 
 
 		 243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  54.01 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  55.25 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  50.43 
 
 		 242 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  50.9 
 
 		 239 aa  214  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  40.38 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  41.05 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  39.17 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  34.76 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  39.66 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  38.82 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  36.6 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  38.02 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  37.04 
 
 		 279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  31 
 
 		 220 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  35.89 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  37.72 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  39.73 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 239 aa  134  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  34.32 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  36.51 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  36.64 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  35.39 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  34.32 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  42.71 
 
 		 213 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  34.5 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  32.05 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  34.43 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  34.48 
 
 		 230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  30.87 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  35.44 
 
 		 262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  39.38 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  34.15 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  34.15 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  34.48 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  29.54 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  35.32 
 
 		 267 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  35.39 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  38.56 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  40.25 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  32.61 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  33.87 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  37.34 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  34.91 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  32.22 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36 
 
 		 246 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  34.88 
 
 		 268 aa  118  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  34.43 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  35.68 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  31.15 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  37.91 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  36.75 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  34.58 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  38.26 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  31.22 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.07 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  37.67 
 
 		 233 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  34.91 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  33.33 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  34.88 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  39.11 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  35.07 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  41.36 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  29.92 
 
 		 247 aa  111  9e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  38.39 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  32.52 
 
 		 269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  31.33 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  35.32 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  34.04 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  31.88 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  36.45 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  31.88 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  34.47 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  32.77 
 
 		 232 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  31.17 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  32.65 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  36.28 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  36.61 
 
 		 223 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  35.48 
 
 		 233 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  31.62 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  35.04 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.08 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  26.67 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  32.77 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  35.34 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  25.86 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>