More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7594 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  100 
 
 
267 aa  533  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  70.72 
 
 
271 aa  374  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  71.89 
 
 
270 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  72.69 
 
 
272 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  71.43 
 
 
271 aa  343  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  71.03 
 
 
254 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  74.9 
 
 
269 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  51.57 
 
 
264 aa  241  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  50.4 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  49.41 
 
 
262 aa  228  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  51.72 
 
 
236 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  48.15 
 
 
255 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  52 
 
 
268 aa  224  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  49.78 
 
 
262 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  49.57 
 
 
258 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  50.81 
 
 
255 aa  223  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  49.41 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  50.2 
 
 
255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  48.28 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  52.02 
 
 
255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  50 
 
 
253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  49.79 
 
 
258 aa  202  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  49.8 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  48.05 
 
 
246 aa  185  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  54.87 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  44.63 
 
 
251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  44.64 
 
 
255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  45.62 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  46.38 
 
 
260 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  44.58 
 
 
248 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  45.33 
 
 
215 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  40.6 
 
 
243 aa  157  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  41.88 
 
 
242 aa  155  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  40.26 
 
 
240 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  40.69 
 
 
240 aa  145  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  40.26 
 
 
240 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  40.25 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  38.43 
 
 
259 aa  138  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  38.12 
 
 
238 aa  136  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  27.39 
 
 
230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  35.22 
 
 
229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  39.73 
 
 
239 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  29.74 
 
 
230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  39.57 
 
 
258 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.48 
 
 
238 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  37.16 
 
 
239 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  35.32 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2585  competence protein F  39.83 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  35.38 
 
 
251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  34.48 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  32.5 
 
 
247 aa  113  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  34.91 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  32.46 
 
 
233 aa  112  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  30.7 
 
 
230 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  31.28 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  33.33 
 
 
233 aa  110  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  34.69 
 
 
246 aa  110  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  34.98 
 
 
279 aa  110  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.58 
 
 
233 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  34.91 
 
 
239 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  35.17 
 
 
227 aa  108  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  35.47 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  35.27 
 
 
249 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 
213 aa  107  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  26.69 
 
 
270 aa  107  2e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  32.76 
 
 
244 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1776  competence protein F, putative  37.2 
 
 
239 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 
239 aa  106  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 
245 aa  106  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  30.97 
 
 
226 aa  106  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  32.63 
 
 
227 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  35.78 
 
 
299 aa  105  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  30.21 
 
 
239 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  32.77 
 
 
227 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  35.56 
 
 
227 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  32.35 
 
 
227 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  32.77 
 
 
227 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  32.35 
 
 
227 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  31.44 
 
 
230 aa  102  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  32.35 
 
 
227 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  32.35 
 
 
227 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  32.77 
 
 
227 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  32.77 
 
 
227 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  35.15 
 
 
227 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  32.35 
 
 
248 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  35.15 
 
 
227 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  32.2 
 
 
286 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.68 
 
 
206 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  29.44 
 
 
234 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
246 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  30.86 
 
 
236 aa  101  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  34.73 
 
 
227 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  40 
 
 
232 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  35.71 
 
 
255 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  39.52 
 
 
233 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  36.6 
 
 
227 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
223 aa  100  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>