282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1140 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 264 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  72.88 
 
 		 268 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  53.28 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  53.75 
 
 		 270 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  54.73 
 
 		 255 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  55.51 
 
 		 255 aa  252  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  57.64 
 
 		 255 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  54.7 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  53.85 
 
 		 272 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  53.62 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  53.59 
 
 		 267 aa  225  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  48.95 
 
 		 253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  53.88 
 
 		 269 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  58.26 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  52.38 
 
 		 236 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  48.54 
 
 		 258 aa  208  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  57.39 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  45.27 
 
 		 255 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  44.68 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  45.69 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  45.26 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  45.26 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  45.26 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  48.29 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  43.03 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  40.57 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  43.04 
 
 		 242 aa  172  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  45.19 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  40.65 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  40.83 
 
 		 238 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  42.27 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  37.87 
 
 		 243 aa  142  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  43.42 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  29.96 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  40.42 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  40.64 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  39.58 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  40 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  37.86 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  39.72 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  38.82 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.62 
 
 		 240 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  29.41 
 
 		 230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  36.91 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  35.89 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2585  competence protein F  38.84 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  33.87 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  35.32 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  37.93 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  31.44 
 
 		 227 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  27.97 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  37.1 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  29.58 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  34.75 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  29.58 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  34.05 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  29.74 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  35.78 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  30.22 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 		 239 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  50.82 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  34.03 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 		 239 aa  102  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  34.19 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.03 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  35.94 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  31.14 
 
 		 226 aa  99.8  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  29.36 
 
 		 245 aa  99.4  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  28.92 
 
 		 236 aa  99.4  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  34.05 
 
 		 233 aa  99  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  32.51 
 
 		 233 aa  99  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  34.11 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  39.5 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  29.54 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.43 
 
 		 206 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  36.14 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  31.68 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.3 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  36.12 
 
 		 279 aa  95.9  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  39.17 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  36.84 
 
 		 230 aa  95.5  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  33.46 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  34.8 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  30.43 
 
 		 231 aa  94  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  36.73 
 
 		 237 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  30.98 
 
 		 247 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  34.14 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  31.64 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 231 aa  92  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  35.04 
 
 		 241 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  35.68 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  32.6 
 
 		 243 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  33.47 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>