298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3909 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  100 
 
 		 238 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  53.98 
 
 		 230 aa  254  7e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  60.34 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  60.34 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4395  ComF family protein  56.44 
 
 		 238 aa  231  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  48.71 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1671  ComF family protein  49.38 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  48.07 
 
 		 255 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  47.77 
 
 		 230 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  36.29 
 
 		 296 aa  141  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  41.7 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  41.83 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  42.79 
 
 		 241 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  42.11 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  38.05 
 
 		 243 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  35.96 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.89 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  40.71 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  37.89 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  36.97 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  40.97 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  40 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  39.13 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  38.26 
 
 		 255 aa  110  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  33.82 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  37.04 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  38.39 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  37.21 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  38.65 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  41.67 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  36.84 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  40.09 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.31 
 
 		 245 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  30.74 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  37.05 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  34.93 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  34.75 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  28.64 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  44.5 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  38.14 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  36.64 
 
 		 261 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  37.3 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  30.33 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  40.32 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  39.91 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  41.67 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  38.97 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  28 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  39.13 
 
 		 271 aa  98.6  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 220 aa  98.2  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00615  amidophosphoribosyltransferase  32.58 
 
 		 185 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  42.64 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  27.65 
 
 		 231 aa  97.4  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  29.09 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0669  ComF family protein  36.12 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  34.51 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0504  putative competence protein  36.12 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  28.03 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0486  putative competence protein  36.12 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  35.96 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  35.81 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2846  ComF family protein  35.68 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0173  ComF family protein  35.68 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1419  ComF family protein  35.68 
 
 		 255 aa  95.9  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  49.59 
 
 		 253 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  40.48 
 
 		 255 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3200  ComF family protein  35.68 
 
 		 242 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  35.34 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3826  gluconate periplasmic binding protein  35.19 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  35.34 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3709  gluconate periplasmic binding protein  35.34 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.604176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  35.29 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 247 aa  95.1  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  35.81 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  34.91 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  35.96 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  35.53 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  35.53 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  35.53 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  36.4 
 
 		 269 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  35.53 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 		 237 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  38.2 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  35.53 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  35.51 
 
 		 262 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  35.53 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  34.75 
 
 		 268 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  38.84 
 
 		 237 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  39.27 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3784  gluconate periplasmic binding protein  34.48 
 
 		 227 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  31.02 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>