297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1808 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  100 
 
 
262 aa  533  1e-150  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  99.24 
 
 
262 aa  526  1e-148  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  82.82 
 
 
262 aa  447  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  62.6 
 
 
270 aa  267  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  55.36 
 
 
258 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  55.36 
 
 
258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  54.59 
 
 
236 aa  255  6e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  51.44 
 
 
270 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  53.94 
 
 
255 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  52.89 
 
 
271 aa  241  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  51.85 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  54.77 
 
 
255 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  51.74 
 
 
255 aa  228  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  49.58 
 
 
251 aa  227  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  51.97 
 
 
254 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  52.4 
 
 
271 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  51.53 
 
 
272 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  51.33 
 
 
258 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  50.66 
 
 
267 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  45 
 
 
258 aa  208  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  51.09 
 
 
269 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  45.31 
 
 
255 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  45.26 
 
 
264 aa  194  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
268 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  46.06 
 
 
246 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  52.67 
 
 
264 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  50.8 
 
 
279 aa  184  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 
215 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  41.23 
 
 
248 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  31.49 
 
 
230 aa  150  2e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  31.49 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  40.08 
 
 
259 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  37.24 
 
 
242 aa  138  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  35.86 
 
 
243 aa  138  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  37.83 
 
 
240 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  38.1 
 
 
217 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  39.39 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  37.08 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.39 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  35.96 
 
 
229 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  38.26 
 
 
240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
239 aa  124  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  38.26 
 
 
258 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  36.53 
 
 
238 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  35.87 
 
 
239 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 
247 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  36 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.18 
 
 
238 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2585  competence protein F  36.29 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  34.91 
 
 
245 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  32.05 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.87 
 
 
245 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  36.36 
 
 
227 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 
279 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  32.38 
 
 
247 aa  105  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  31.91 
 
 
244 aa  105  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  34.58 
 
 
251 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  31.4 
 
 
249 aa  101  9e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  30 
 
 
227 aa  102  9e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  36.27 
 
 
233 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  29.18 
 
 
239 aa  99  7e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  33.33 
 
 
239 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  29 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  46.61 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  27.51 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  33.33 
 
 
233 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  36.08 
 
 
231 aa  96.3  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.73 
 
 
245 aa  96.3  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  31.06 
 
 
230 aa  95.9  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
230 aa  95.5  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  32.3 
 
 
241 aa  95.1  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  30.99 
 
 
239 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.6 
 
 
233 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  31.8 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  32.42 
 
 
299 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  31.9 
 
 
233 aa  92.4  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  30.8 
 
 
262 aa  92.4  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  30.31 
 
 
269 aa  92  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  31.47 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  31.47 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  31.47 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  31.86 
 
 
241 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  31.47 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  31.47 
 
 
227 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3888  gluconate periplasmic binding protein  31.47 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  30.74 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3794  gluconate periplasmic binding protein  31.47 
 
 
227 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  36.82 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3694  gluconate periplasmic binding protein  31.72 
 
 
227 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  26.2 
 
 
234 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  28.81 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3880  gluconate periplasmic binding protein  32.33 
 
 
227 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  38.46 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3712  gluconate periplasmic binding protein  32.33 
 
 
227 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  30.3 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  29.83 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1671  ComF family protein  33.19 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  26.59 
 
 
247 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 
230 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>