292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0307 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  100 
 
 		 255 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  97.65 
 
 		 255 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  84.71 
 
 		 255 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  66.53 
 
 		 253 aa  315  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  65.2 
 
 		 264 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  68.09 
 
 		 279 aa  265  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  55.51 
 
 		 264 aa  252  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  53.94 
 
 		 262 aa  241  7.999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  51.22 
 
 		 262 aa  241  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  54.15 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  52.4 
 
 		 270 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  53.1 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  53.36 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  53.94 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  50.22 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  50.22 
 
 		 258 aa  214  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  52.3 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  49.8 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  52.12 
 
 		 267 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  45.45 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  48.98 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  49 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  52.81 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  44.08 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3006  phosphoribosyltransferase  47.41 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  47.3 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  44.53 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  39.92 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  39.33 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  41.63 
 
 		 217 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  39.08 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  40.64 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.17 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  39.29 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  28.38 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  42.73 
 
 		 260 aa  131  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  35.78 
 
 		 229 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  29.26 
 
 		 230 aa  129  6e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  37.07 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 		 239 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  36.21 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  35.39 
 
 		 245 aa  125  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  37.2 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  33.57 
 
 		 279 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  35.98 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  35.83 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.71 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  37.27 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  35.8 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  34.76 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  28.46 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  36.28 
 
 		 247 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  35.95 
 
 		 249 aa  115  6e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  31.15 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  33.04 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  37.66 
 
 		 258 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  42.46 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  33.74 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  37.74 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2585  competence protein F  36.55 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  39.07 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.29 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  32.93 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  39.62 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  28.93 
 
 		 234 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 		 246 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  30.26 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  28.93 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  36.67 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  36.06 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.61 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  43.04 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  32.77 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  25.75 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  37.36 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  33.19 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  34.91 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  31.28 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  36.82 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  32.64 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 239 aa  100  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.85 
 
 		 215 aa  98.6  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  50.83 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  29.72 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2857  phosphoribosyltransferase  41.21 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  33.04 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  29.83 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1776  competence protein F, putative  35.89 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  29.96 
 
 		 269 aa  95.1  8e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>