298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2371 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 231 aa  480  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  58.01 
 
 		 230 aa  277  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  58.01 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  47.37 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  47.78 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  41.23 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  31.88 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  32.11 
 
 		 230 aa  118  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  32.31 
 
 		 246 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  34.17 
 
 		 255 aa  108  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.61 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  36.78 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  31.69 
 
 		 258 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.37 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  32.52 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  30.04 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  30.3 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  32.05 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  33.65 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  32.79 
 
 		 255 aa  101  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  31.4 
 
 		 236 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  34.57 
 
 		 262 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 255 aa  98.2  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  28.09 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  29.44 
 
 		 262 aa  97.4  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 		 268 aa  95.9  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 245 aa  95.1  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  35.05 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  31.62 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  30.51 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  32.35 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  32.35 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 		 264 aa  92.8  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  32.86 
 
 		 273 aa  92  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 		 232 aa  91.7  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  35.11 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  29.13 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  29.88 
 
 		 245 aa  90.1  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  29.11 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  38.36 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  34.1 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  32 
 
 		 239 aa  89  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  28.09 
 
 		 270 aa  89  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  32.03 
 
 		 274 aa  89  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  30.84 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  29.05 
 
 		 243 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  31.65 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  28.39 
 
 		 229 aa  87.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  31.91 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  28.39 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  27.51 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  27.39 
 
 		 270 aa  86.3  4e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  30.8 
 
 		 242 aa  86.3  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  27.43 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.36 
 
 		 206 aa  85.5  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  34.69 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  32.54 
 
 		 252 aa  85.1  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  29.58 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  31.56 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  34.34 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  29.2 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  29.57 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1708  phosphoribosyltransferase  36.44 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0852956  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  33.99 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  32.39 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  32.5 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  33.8 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  34.44 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  30.36 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  30.34 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  28.45 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  38.41 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  32.6 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  31.29 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  24.77 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  40.54 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  32.93 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  43.59 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  26.84 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0998  hypothetical protein  34.03 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.338338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  28.81 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  26.84 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  31.86 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  26.22 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  34.13 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  30.74 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 279 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  31.25 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  37.84 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>