287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02872 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  100 
 
 		 118 aa  229  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  73.5 
 
 		 241 aa  173  8e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  73.5 
 
 		 241 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  45.69 
 
 		 204 aa  116  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  53.98 
 
 		 263 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  53.98 
 
 		 237 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  52.14 
 
 		 246 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  56.36 
 
 		 231 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 239 aa  108  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  57.39 
 
 		 262 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  53.39 
 
 		 243 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  54.81 
 
 		 237 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  51.33 
 
 		 233 aa  103  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  53.39 
 
 		 243 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  53.39 
 
 		 243 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  57.26 
 
 		 238 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  51.24 
 
 		 246 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  43.36 
 
 		 234 aa  97.1  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  51.67 
 
 		 244 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  43.36 
 
 		 234 aa  96.3  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  50.41 
 
 		 244 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  51.3 
 
 		 261 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  44.74 
 
 		 247 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  49.57 
 
 		 261 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  50 
 
 		 266 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  49.58 
 
 		 268 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  42.61 
 
 		 242 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  45.69 
 
 		 230 aa  90.9  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  48.7 
 
 		 241 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  50 
 
 		 251 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  50.43 
 
 		 279 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  51.22 
 
 		 241 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  49.58 
 
 		 245 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  48.74 
 
 		 222 aa  87.8  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  50.83 
 
 		 246 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  48.67 
 
 		 242 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  55.79 
 
 		 269 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 238 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  40.18 
 
 		 227 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  39.5 
 
 		 245 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  49.09 
 
 		 223 aa  86.3  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  54.55 
 
 		 242 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  50 
 
 		 241 aa  85.9  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  47.79 
 
 		 252 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3529  competence protein ComF  45.13 
 
 		 293 aa  85.9  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  56.9 
 
 		 242 aa  84.7  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  46.61 
 
 		 243 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3458  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  39.34 
 
 		 250 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000183907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  47.01 
 
 		 240 aa  84.3  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  48.78 
 
 		 241 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  45.61 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0164  gluconate periplasmic binding protein  41.74 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  47.79 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  48.65 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3989  gluconate periplasmic binding protein  41.74 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  48.76 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3749  gluconate periplasmic binding protein  41.74 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  49.56 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  38.6 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  46.15 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  49 
 
 		 239 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4625  competence protein ComF  46.9 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  43.64 
 
 		 247 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  49 
 
 		 239 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  45.13 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  45.3 
 
 		 250 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  43.97 
 
 		 244 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  45.28 
 
 		 269 aa  80.1  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  41.03 
 
 		 231 aa  80.5  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  45.13 
 
 		 263 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  44.74 
 
 		 268 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  46.02 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  43.59 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  42.48 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  37.93 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  48.31 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4126  competence protein ComF  45.13 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  46.02 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  47.83 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  45.13 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  43.59 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  40.54 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 		 229 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  44.83 
 
 		 262 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  39.09 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  42.73 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  43.48 
 
 		 276 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  35.34 
 
 		 226 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  42.15 
 
 		 239 aa  77  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  41.53 
 
 		 259 aa  77.4  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  42.99 
 
 		 226 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  49.53 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  43.1 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  45.22 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  51.61 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  51.09 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  42.37 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>