295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0359 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0359  putative competence protein F-related protein  100 
 
 		 240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.332104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  76.42 
 
 		 240 aa  336  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  72.93 
 
 		 240 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  49.78 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  50 
 
 		 268 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  47.84 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  46.75 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  48.15 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  40.83 
 
 		 239 aa  151  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2767  phosphoribosyltransferase  47.54 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  48.25 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  43.51 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2905  phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  43.35 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0486  putative competence protein  48.47 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0504  putative competence protein  48.47 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0669  ComF family protein  48.47 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  43.67 
 
 		 230 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  41.74 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3200  ComF family protein  48.47 
 
 		 242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0173  ComF family protein  48.47 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2846  ComF family protein  48.47 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1419  ComF family protein  48.47 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  41.48 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  40.42 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6179  phosphoribosyltransferase  47.66 
 
 		 263 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  40.65 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2861  phosphoribosyltransferase  45.61 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.603337 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  40.43 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  41.63 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  40.08 
 
 		 271 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  35.02 
 
 		 296 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  44.74 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2236  phosphoribosyltransferase  46.03 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  44.68 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2850  phosphoribosyltransferase  46.03 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  39.3 
 
 		 243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  33.96 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  44.3 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  40.08 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  37.5 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  40.08 
 
 		 263 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  41.06 
 
 		 259 aa  123  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  41.31 
 
 		 246 aa  122  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  38.84 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  35.71 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  35.27 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  37.05 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  38.43 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  39.82 
 
 		 241 aa  118  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  39.44 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  44.6 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  38.39 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1942  phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  36.64 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  36.21 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  34.84 
 
 		 243 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  43.27 
 
 		 213 aa  111  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  35.33 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  39.76 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1678  ComF family protein  37.61 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.591029  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  33.62 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  32.55 
 
 		 237 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4395  ComF family protein  40.43 
 
 		 238 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136408  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  34.15 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  32.42 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  31.38 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  41.2 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  34.26 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  30.58 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35.5 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1671  ComF family protein  38.53 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.56 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 		 222 aa  99  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.05 
 
 		 238 aa  98.6  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  30.64 
 
 		 232 aa  98.6  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  35.96 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  34.29 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  37.08 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 		 264 aa  96.3  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  37.09 
 
 		 247 aa  96.3  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  40.91 
 
 		 299 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  38.36 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  36.12 
 
 		 241 aa  95.9  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  33.91 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  33.79 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  33.78 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  37.86 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  38.83 
 
 		 217 aa  91.7  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  35.2 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  33.9 
 
 		 249 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  32.41 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  33.62 
 
 		 258 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>