More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3242 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  79.72 
 
 		 215 aa  334  7.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  41.59 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  41.59 
 
 		 233 aa  158  7e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  42.48 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2548  amidophosphoribosyltransferase-like protein  53.43 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  38.96 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  38.96 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  31.8 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  38.86 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  39.15 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  40.66 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  34.41 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  40.41 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  35.78 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  37.28 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  33.64 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  41.72 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  30.33 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  41.36 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.97 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  41.85 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  37.17 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  40.96 
 
 		 247 aa  102  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  40 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  35.91 
 
 		 237 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  36.41 
 
 		 234 aa  102  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  34.88 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  33.18 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  34.48 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  32.71 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  33.01 
 
 		 221 aa  99.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  36.1 
 
 		 243 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  28.77 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  35.87 
 
 		 234 aa  98.6  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  41.51 
 
 		 207 aa  98.6  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  33.97 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  34.8 
 
 		 241 aa  96.7  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  30.88 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  33.76 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  28.44 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  39.6 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31.68 
 
 		 239 aa  96.3  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  30.66 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  35 
 
 		 247 aa  95.5  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 		 231 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  38.54 
 
 		 243 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  38.15 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.69 
 
 		 206 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  36.08 
 
 		 286 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  40.25 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  36.59 
 
 		 243 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  35.93 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  35.11 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  31.25 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  28.78 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  29.9 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 		 230 aa  92  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  34.62 
 
 		 255 aa  91.7  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  28.89 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  38.05 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  40.14 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  40.59 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  37.72 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  39.49 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  35.37 
 
 		 264 aa  89.4  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  43.15 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  32.91 
 
 		 245 aa  89  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  50.44 
 
 		 118 aa  89  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  31.86 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  43.51 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  39.63 
 
 		 299 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  25.63 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  38.84 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  34.62 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  36.56 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  41.52 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  37.12 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  32.83 
 
 		 247 aa  86.3  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 271 aa  86.3  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  41.25 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  34.62 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  45.38 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  41.71 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  37.19 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1942  phosphoribosyltransferase  29.27 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  36.63 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4198  competence protein ComF  36.32 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  33.33 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  28.64 
 
 		 229 aa  85.5  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2082  phosphoribosyltransferase  39.22 
 
 		 214 aa  85.1  8e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0714276  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  29.46 
 
 		 243 aa  85.1  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>