More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3333 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 242 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  67.57 
 
 		 238 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  61.97 
 
 		 238 aa  294  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  51.05 
 
 		 243 aa  241  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  50.43 
 
 		 245 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  52.7 
 
 		 239 aa  218  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  47.12 
 
 		 247 aa  178  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  38.15 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  40.43 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  40.26 
 
 		 259 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  40.57 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  39.24 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  39.26 
 
 		 258 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  37.83 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  39.22 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  41.36 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  37.45 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  39.75 
 
 		 255 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  38.03 
 
 		 271 aa  142  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  44.49 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  36.32 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 		 255 aa  135  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  38.4 
 
 		 246 aa  135  8e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  36.4 
 
 		 262 aa  131  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1776  competence protein F, putative  41.9 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  38.63 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  38.4 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  37.08 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  32.5 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  35.98 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  38.03 
 
 		 228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  35.56 
 
 		 233 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  38.7 
 
 		 256 aa  129  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 		 264 aa  128  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  37.55 
 
 		 244 aa  128  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  32.92 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  32.92 
 
 		 234 aa  128  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  38.98 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  40.17 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  36.74 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  36.55 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  30.57 
 
 		 220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  38.75 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 		 271 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  28.51 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  35.68 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  39.32 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  36.8 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  33.2 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  37.28 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  40.59 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.78 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  35.11 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  34.35 
 
 		 232 aa  122  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3415  ComF family protein  37.75 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  38.24 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  36.64 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 		 213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  37.29 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  34.76 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  34.82 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.61 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.6 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  35.47 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  39.06 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  35.47 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  29.05 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  35.19 
 
 		 255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  27.35 
 
 		 270 aa  118  6e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  36.15 
 
 		 269 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  40.59 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  37 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  30.04 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  37.6 
 
 		 240 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  38.76 
 
 		 217 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  38.46 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3816  putative phosphoribosyl transferase  36.21 
 
 		 266 aa  114  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.231863 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3500  competence protein F  36.57 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  32.58 
 
 		 296 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  37.34 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  37.39 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  37.6 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  36.44 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  36.73 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  36.73 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0300  comF family protein  37.05 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00612033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 		 276 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  38.6 
 
 		 241 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  35.84 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  37.05 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  37.07 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  37.05 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>