288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1401 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  38.6 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  36.77 
 
 		 246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  35.62 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  31.03 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  37.61 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  29.24 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.07 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.07 
 
 		 258 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.13 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  33.77 
 
 		 243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  34.05 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  31 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 		 246 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  31.12 
 
 		 245 aa  108  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  31 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  33.18 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  32.89 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  37.99 
 
 		 271 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  32.89 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 		 258 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.15 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  30.43 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  35.53 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  33.61 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  34.36 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  32.78 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.15 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  26.96 
 
 		 220 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  33.77 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  35.74 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  28.51 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  34.78 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  40.86 
 
 		 269 aa  99  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  34.21 
 
 		 231 aa  98.6  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  34.03 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  32.07 
 
 		 255 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  31.25 
 
 		 239 aa  98.6  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  31.67 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0258  amidophosphoribosyltransferases-like protein  36.56 
 
 		 279 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  31.92 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  35.66 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  35.96 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  30.8 
 
 		 230 aa  97.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  36.75 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  30.3 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0875  hypothetical protein  34.41 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.656742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  34.21 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  29.18 
 
 		 236 aa  96.3  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  34.2 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  32.22 
 
 		 274 aa  95.1  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  27.47 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.48 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  36.4 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31.17 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  36.11 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  35.9 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 239 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  31.25 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  33.33 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  35.04 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 		 260 aa  92.4  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4009  competence protein ComF  34.65 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0453  phosphoribosyltransferase  35.17 
 
 		 257 aa  92  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  28.26 
 
 		 220 aa  92  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  28.95 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  33.92 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  33.33 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  32.91 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  28.57 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 		 279 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  31.88 
 
 		 245 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  30.9 
 
 		 258 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.19 
 
 		 240 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  31.51 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03265  gluconate periplasmic binding protein with phosphoribosyltransferase domain, GNT I system  30.87 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00626502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03217  hypothetical protein  30.87 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00548769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0300  gluconate periplasmic binding protein  30.87 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0414054  normal  0.0237558 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3610  gluconate periplasmic binding protein  30.87 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  33.04 
 
 		 268 aa  89  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  33.04 
 
 		 268 aa  89  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 243 aa  88.6  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  30.04 
 
 		 262 aa  88.6  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4720  gluconate periplasmic binding protein  30.87 
 
 		 248 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.39 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  31.93 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>