More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0165 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  100 
 
 
223 aa  454  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  41.89 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  35.71 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.14 
 
 
233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  42.52 
 
 
235 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  33.93 
 
 
233 aa  121  9e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  37.5 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  36.99 
 
 
263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  33.18 
 
 
221 aa  115  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  36.99 
 
 
237 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  38.6 
 
 
247 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  40.72 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  36.44 
 
 
242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  35.95 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.55 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2548  amidophosphoribosyltransferase-like protein  42.18 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332374  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  35.9 
 
 
255 aa  109  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  39.64 
 
 
227 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  37.93 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  34.91 
 
 
253 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.8 
 
 
229 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  38.91 
 
 
239 aa  107  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  31.58 
 
 
247 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  36.24 
 
 
259 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  33.9 
 
 
255 aa  104  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  33.61 
 
 
255 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  32.13 
 
 
226 aa  103  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  32.79 
 
 
254 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  36.48 
 
 
246 aa  102  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  33.47 
 
 
258 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  34.2 
 
 
262 aa  101  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  33.05 
 
 
258 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  33.61 
 
 
255 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  33.33 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  36.61 
 
 
245 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 
232 aa  98.6  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  35.43 
 
 
230 aa  98.2  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.64 
 
 
220 aa  96.7  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  31.28 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  35.9 
 
 
236 aa  95.9  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  33.33 
 
 
232 aa  96.3  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  29.06 
 
 
245 aa  95.5  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  31.28 
 
 
271 aa  94.7  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  32.08 
 
 
270 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4601  competence protein F  34.62 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  31.09 
 
 
279 aa  94  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  30.91 
 
 
236 aa  93.2  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  33.33 
 
 
267 aa  92.4  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  30 
 
 
230 aa  91.7  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  34.65 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  33.48 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  30.36 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
239 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  34.65 
 
 
241 aa  89.4  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  32.38 
 
 
236 aa  89  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  37.01 
 
 
230 aa  89  5e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 
220 aa  88.6  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  39.37 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  31.15 
 
 
262 aa  88.2  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  37.56 
 
 
217 aa  88.6  8e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  31.6 
 
 
247 aa  88.2  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  32.14 
 
 
269 aa  88.2  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  34.72 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  33.06 
 
 
269 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  26.61 
 
 
231 aa  87.8  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  30.83 
 
 
271 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0661  phosphoribosyltransferase  32.87 
 
 
222 aa  87  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  37.5 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  35.59 
 
 
258 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 
213 aa  87  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0964  competence protein F  34.93 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.186379  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  33.5 
 
 
237 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  37.89 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  27.16 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  30.14 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  49.09 
 
 
118 aa  86.3  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 
269 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  37.55 
 
 
256 aa  85.9  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  28.32 
 
 
239 aa  85.1  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  38.27 
 
 
244 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  30.17 
 
 
249 aa  85.1  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4814  phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.727604  decreased coverage  0.0000849043 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
276 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  33.03 
 
 
232 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  33.2 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  31.7 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  45.76 
 
 
242 aa  82.8  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  34.33 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  30.28 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  31.11 
 
 
228 aa  82  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  39.35 
 
 
244 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  29.21 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  35.12 
 
 
247 aa  81.3  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  39.6 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  32.62 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  32.55 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 
230 aa  80.1  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>