276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2014 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  50.44 
 
 		 230 aa  224  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  44.93 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  41.59 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  41.63 
 
 		 269 aa  170  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  40.45 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  42.86 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  31.34 
 
 		 230 aa  112  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  34.05 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  29.39 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  30.7 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  33.62 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  32.54 
 
 		 273 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  33.78 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  29.31 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  34.07 
 
 		 207 aa  95.9  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.7 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  30.71 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  35.48 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  36.02 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  31.39 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  31.39 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  28.02 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  35.26 
 
 		 247 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  25.2 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  27.71 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32 
 
 		 258 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  39.75 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  23.04 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  32.89 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  29.46 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.67 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  35.47 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  36.13 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  32.5 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  32.5 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  30.84 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  31.44 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  31.56 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  28.84 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  29.69 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  32.84 
 
 		 235 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  31.76 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  30.08 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  32.17 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  29.91 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  26.43 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  24.35 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  30.88 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3800  competence protein ComF  31.07 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  34.38 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  30.17 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  32.8 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  30.14 
 
 		 243 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  30.92 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  30.12 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  42.73 
 
 		 118 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  29.96 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.92 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  24.69 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  24.38 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  30.09 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  30.49 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  30.51 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  30.6 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2757  putative phosphoribosyl transferase  31.36 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2095  phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00900618  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  36.69 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  34.05 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  27.31 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  31.43 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  29.33 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  28.07 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  33.96 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4330  competence protein ComF  30.92 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  34.69 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3805  competence protein ComF  30.2 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.274004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  30 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  36.88 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  27.49 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0541  phosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  29.76 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  30.45 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  32.42 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0141  competence protein ComF  30.43 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  30 
 
 		 230 aa  72.8  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>