More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0911 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  527  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  45.79 
 
 
229 aa  216  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  44.39 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  44.39 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  43.41 
 
 
219 aa  192  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  38.1 
 
 
243 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  33.94 
 
 
246 aa  125  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.09 
 
 
215 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  30.73 
 
 
245 aa  99.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  29.66 
 
 
233 aa  98.6  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  29.24 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  31.8 
 
 
235 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 
217 aa  95.1  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  27.35 
 
 
258 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  34.19 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
276 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  26.94 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  35.05 
 
 
279 aa  89.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.69 
 
 
233 aa  89.7  4e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  29.74 
 
 
246 aa  89  7e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  27.8 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  29.65 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  33.02 
 
 
207 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  34.81 
 
 
238 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  32.37 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
230 aa  86.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  32.34 
 
 
220 aa  86.3  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  30.45 
 
 
237 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  29.8 
 
 
255 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  27.93 
 
 
230 aa  85.1  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  28.79 
 
 
213 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  30.33 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  27.07 
 
 
239 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.85 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  28.51 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  29.22 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  31.21 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  25.11 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  28.57 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  30.59 
 
 
271 aa  82.4  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  29.36 
 
 
260 aa  82.4  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  31.14 
 
 
299 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
247 aa  82  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  29.8 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  32.93 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.14 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  30.77 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  27.49 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  28.65 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  30.32 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  27.66 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 
239 aa  79.7  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  27.11 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 
258 aa  79  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  27.23 
 
 
228 aa  79  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.86 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  29.3 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  29.72 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  30 
 
 
243 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  25.63 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  27.43 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  31.14 
 
 
240 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  32.08 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  25.2 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  26.29 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  26 
 
 
245 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 
268 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  27.75 
 
 
273 aa  76.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2440  phosphoribosyltransferase  24.02 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000223825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  29.95 
 
 
223 aa  76.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  32.12 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  27.66 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  29.3 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28.26 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  27.07 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  28.1 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  28.63 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  28.22 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  24.68 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  25 
 
 
204 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 
272 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  25.62 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  33.96 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  36.13 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  30.67 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  25.5 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  25.7 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  30.34 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  29.27 
 
 
269 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3051  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.76 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0157  competence protein ComF  28.07 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  31.45 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  28.04 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  28.3 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  26.48 
 
 
242 aa  72.4  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3201  amidophosphoribosyltransferase  24.89 
 
 
226 aa  72  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.387541  normal  0.0162666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>