More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0877 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 232 aa  484  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 		 232 aa  187  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  40.81 
 
 		 226 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  38.54 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  39.3 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  33.04 
 
 		 226 aa  159  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  33.33 
 
 		 229 aa  139  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  34.1 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  32.62 
 
 		 236 aa  122  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  34.09 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  34.58 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  33.19 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.07 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  31.65 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  31.47 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  30.83 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  31.95 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.93 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  34.35 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  29.55 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  32.55 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  33.61 
 
 		 255 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  34.58 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  30.84 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  30.8 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  29.68 
 
 		 279 aa  99.4  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  27.66 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 246 aa  98.6  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  30.04 
 
 		 269 aa  98.6  8e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  32.49 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  31.84 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06360  putative phosphoribosyl transferase  32.87 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00829668  normal  0.955973 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  32.18 
 
 		 256 aa  96.3  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  31.22 
 
 		 246 aa  95.1  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  28.64 
 
 		 231 aa  95.1  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  36.88 
 
 		 246 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  29.27 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  31.37 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0592  putative phosphoribosyl transferase  32.37 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  36.67 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  30.3 
 
 		 248 aa  92.4  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  32.23 
 
 		 244 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  37.09 
 
 		 242 aa  92  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 223 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  26.32 
 
 		 243 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 230 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  37.09 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  29.72 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  30.51 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  31.36 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  31.48 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  26.79 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  36.84 
 
 		 236 aa  88.6  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  30.61 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 		 222 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  32.14 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  27.98 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  29.87 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  27.93 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  29.06 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  28.51 
 
 		 273 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  29.19 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  28.95 
 
 		 233 aa  85.1  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  30.81 
 
 		 267 aa  85.5  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  29.17 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.31 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  33.99 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  31.48 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  29.49 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  27.31 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  29.15 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  28.22 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  29.71 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  29.6 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  29.36 
 
 		 271 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  30.18 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  27.98 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  32.91 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  32.91 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  27.85 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  31.71 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  29.49 
 
 		 243 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  32.35 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  25.45 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1878  competence protein F, putative  29.29 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1733  ComF family protein  36.36 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00110223  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3881  competence protein ComF  29.06 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  29.66 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  28.57 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>