292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3495 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
236 aa  482  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  37.22 
 
 
232 aa  156  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  38.01 
 
 
239 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  34.67 
 
 
226 aa  155  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  35.91 
 
 
246 aa  128  6e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.2 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  34.36 
 
 
269 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  32.16 
 
 
226 aa  122  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
232 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  31.31 
 
 
230 aa  118  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  30.09 
 
 
229 aa  116  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  28.23 
 
 
243 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 
220 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  30.73 
 
 
238 aa  115  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 
230 aa  114  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
239 aa  111  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  31.9 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  31.17 
 
 
242 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  34.6 
 
 
239 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  32.16 
 
 
230 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  32 
 
 
247 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  29.18 
 
 
245 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  32.7 
 
 
236 aa  106  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.79 
 
 
245 aa  105  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  30.47 
 
 
255 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  32.47 
 
 
229 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30.77 
 
 
258 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.36 
 
 
238 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  31.98 
 
 
246 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  31.14 
 
 
228 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
258 aa  103  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  30.77 
 
 
255 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  26.46 
 
 
220 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  31.42 
 
 
230 aa  101  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  30.67 
 
 
233 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  29.73 
 
 
231 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 
246 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 
264 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  28 
 
 
227 aa  99.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 
239 aa  99.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  32.09 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  32.75 
 
 
217 aa  99  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0311  putative amidophosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
222 aa  98.6  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  28.99 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 
271 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  30.93 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.09 
 
 
240 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  29.72 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  29.91 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  28.63 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  28.16 
 
 
270 aa  96.3  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.91 
 
 
233 aa  95.9  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.09 
 
 
230 aa  95.9  5e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.06 
 
 
258 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  29.65 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 
279 aa  95.1  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  34.55 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  31.33 
 
 
267 aa  94.4  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  27.83 
 
 
233 aa  94  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  34.64 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  30.91 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  32.74 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  40.74 
 
 
240 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  29.73 
 
 
246 aa  92  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  27.35 
 
 
230 aa  92  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  33.13 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1195  competence protein F  30.54 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  30.71 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  27.17 
 
 
268 aa  91.3  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  33.14 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1401  phosphoribosyltransferase  34.01 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  29.88 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  30.43 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  29.91 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  29.91 
 
 
243 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2856  competence protein F  30.96 
 
 
240 aa  89.4  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  30.42 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  38.89 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  25.44 
 
 
234 aa  88.6  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  27.9 
 
 
262 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  26.85 
 
 
204 aa  88.6  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.88 
 
 
243 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  30.65 
 
 
251 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
239 aa  87  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  30.99 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  25 
 
 
234 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  31.92 
 
 
242 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 
271 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  28.11 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1776  competence protein F, putative  26.87 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.280067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  28.44 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
230 aa  84.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  26.13 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1808  putative competence protein F  27.04 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3909  ComF family protein  39.84 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  38.66 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.28 
 
 
215 aa  82.4  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>