More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1236 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  100 
 
 		 233 aa  481  1e-135  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  93.13 
 
 		 233 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  84.12 
 
 		 233 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  39.56 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  38.39 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  41.59 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  38.33 
 
 		 259 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  35.56 
 
 		 242 aa  129  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  34.02 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  34.16 
 
 		 245 aa  122  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  33.77 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.93 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  34.32 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.62 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  33.63 
 
 		 227 aa  119  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  35.16 
 
 		 279 aa  119  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  33.33 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  35.56 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  36.12 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  32.16 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  31.98 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  31.98 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  30.04 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  33.18 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0295  competence protein F, putative  33.19 
 
 		 242 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  31.44 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.29 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  32.17 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  34.05 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  33.2 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  30 
 
 		 258 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  32.46 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 		 220 aa  106  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  32.11 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  32.11 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  33.8 
 
 		 237 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  31.54 
 
 		 246 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  31.22 
 
 		 245 aa  105  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  34.86 
 
 		 239 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.57 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  34.39 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  33.2 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  33.91 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  32.62 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3527  competence protein F, putative  32.07 
 
 		 244 aa  102  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  32.6 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 		 258 aa  101  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  33.19 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  31.86 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  32.77 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  32.22 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  33.04 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  30.61 
 
 		 249 aa  99.8  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  34.58 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  26.67 
 
 		 230 aa  99.4  4e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  31.14 
 
 		 255 aa  99.4  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  28.99 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  29.52 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  29.24 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  30.22 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  28.7 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  35.24 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  35.44 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  30.84 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  31.78 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  27.16 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  33.63 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2141  comFC protein  28.57 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  30.42 
 
 		 262 aa  93.6  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  31.78 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  31.12 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2548  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.94 
 
 		 207 aa  92.8  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.332374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15330  predicted amidophosphoribosyltransferase  31.78 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0698628  normal  0.0235577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  31.43 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  32.33 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0416  putative competence protein F  24.69 
 
 		 270 aa  92.4  5e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  30.43 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2510  phosphoribosyltransferase  31.58 
 
 		 258 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.277662 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  31.51 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  31.08 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  32.46 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.8 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  27.88 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2431  competence protein FC  28.57 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  31.88 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  33.18 
 
 		 242 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  32.44 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  32.33 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  32.59 
 
 		 258 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2292  ComF family protein  31.09 
 
 		 286 aa  89.4  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  34.75 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  31.61 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>